RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431357.1

USP4-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 5

Gene USP4, Length 2,141 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-205ENST00000431357 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.39■□□□□ 0.21
USP4-205ENST00000431357 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.39■□□□□ 0.21
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USP4-205ENST00000431357 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.38■□□□□ 0.21
USP4-205ENST00000431357 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.37■□□□□ 0.21
USP4-205ENST00000431357 ITGAEP38570 1179 aa16.35■□□□□ 0.21
USP4-205ENST00000431357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 36.9
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USP4-205ENST00000431357 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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USP4-205ENST00000431357 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.91■□□□□ 0.14
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USP4-205ENST00000431357 WDR62O43379 1518 aa15.85■□□□□ 0.13
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USP4-205ENST00000431357 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
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USP4-205ENST00000431357 KDM6BO15054 1643 aa15.75■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 DAPK1P53355 1430 aa15.75■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 KIAA0556O60303 1618 aa15.74■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.72■□□□□ 0.11
USP4-205ENST00000431357 DISP1Q96F81 1524 aa15.72■□□□□ 0.11
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