RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430390.5

TTLL3-211, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,674 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-211ENST00000430390 CLIP1P30622 1438 aa18.96■□□□□ 0.63
TTLL3-211ENST00000430390 GRIN2AQ12879 1464 aa18.96■□□□□ 0.63
TTLL3-211ENST00000430390 ADAMTS12P58397 1594 aa18.95■□□□□ 0.62
TTLL3-211ENST00000430390 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.92■□□□□ 0.62
TTLL3-211ENST00000430390 NUP160Q12769 1436 aa18.86■□□□□ 0.61
TTLL3-211ENST00000430390 ARHGEF11O15085 1522 aa18.86■□□□□ 0.61
TTLL3-211ENST00000430390 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.86■□□□□ 0.61
TTLL3-211ENST00000430390 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.85■□□□□ 0.61
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TTLL3-211ENST00000430390 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.83■□□□□ 0.6
TTLL3-211ENST00000430390 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.83■□□□□ 0.6
TTLL3-211ENST00000430390 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.82■□□□□ 0.6
TTLL3-211ENST00000430390 CEP170Q5SW79 1584 aa18.81■□□□□ 0.6
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TTLL3-211ENST00000430390 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.8■□□□□ 0.6
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TTLL3-211ENST00000430390 ARAP1Q96P48 1450 aa18.79■□□□□ 0.6
TTLL3-211ENST00000430390 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.73■□□□□ 0.59
TTLL3-211ENST00000430390 IQGAP2Q13576 1575 aa18.73■□□□□ 0.59
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TTLL3-211ENST00000430390 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.63■□□□□ 0.57
TTLL3-211ENST00000430390 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTLL3-211ENST00000430390 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTLL3-211ENST00000430390 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.59■□□□□ 0.57
TTLL3-211ENST00000430390 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.59■□□□□ 0.57
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TTLL3-211ENST00000430390 MAP3K1Q13233 1512 aa18.57■□□□□ 0.56
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TTLL3-211ENST00000430390 KIAA0556O60303 1618 aa18.53■□□□□ 0.56
TTLL3-211ENST00000430390 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.53■□□□□ 0.56
TTLL3-211ENST00000430390 PTPRGP23470 1445 aa18.52■□□□□ 0.56
TTLL3-211ENST00000430390 DISP1Q96F81 1524 aa18.51■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 P3H3Q8IVL6 736 aa18.5■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.5■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.49■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 TIAM1Q13009 1591 aa18.49■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TTLL3-211ENST00000430390 HECW1Q76N89 1606 aa18.41■□□□□ 0.54
TTLL3-211ENST00000430390 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.38■□□□□ 0.53
TTLL3-211ENST00000430390 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.38■□□□□ 0.53
TTLL3-211ENST00000430390 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.38■□□□□ 0.53
TTLL3-211ENST00000430390 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TTLL3-211ENST00000430390 UACAQ9BZF9 1416 aa18.35■□□□□ 0.53
TTLL3-211ENST00000430390 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.35■□□□□ 0.53
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TTLL3-211ENST00000430390 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.3■□□□□ 0.52
TTLL3-211ENST00000430390 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TTLL3-211ENST00000430390 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.29■□□□□ 0.52
TTLL3-211ENST00000430390 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TTLL3-211ENST00000430390 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.27■□□□□ 0.52
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TTLL3-211ENST00000430390 ABCA8O94911 1581 aa18.27■□□□□ 0.52
TTLL3-211ENST00000430390 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.27■□□□□ 0.51
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TTLL3-211ENST00000430390 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.25■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.23■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 ARID3CA6NKF2 412 aa18.23■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
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TTLL3-211ENST00000430390 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 MAPKBP1O60336 1514 aa18.21■□□□□ 0.51
TTLL3-211ENST00000430390 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.19■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.19■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 ASXL2Q76L83 1435 aa18.18■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.17■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.17■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.16■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 NCOA2Q15596 1464 aa18.15■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 KCNH8Q96L42 1107 aa18.15■□□□□ 0.5
TTLL3-211ENST00000430390 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 26.4
TTLL3-211ENST00000430390 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 ATP10BO94823 1461 aa18.1■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.1■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.08■□□□□ 0.49
TTLL3-211ENST00000430390 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.08■□□□□ 0.48
TTLL3-211ENST00000430390 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.07■□□□□ 0.48
TTLL3-211ENST00000430390 DIP2BQ9P265 1576 aa18.07■□□□□ 0.48
TTLL3-211ENST00000430390 MIA2Q96PC5 1412 aa18.03■□□□□ 0.48
TTLL3-211ENST00000430390 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.02■□□□□ 0.48
TTLL3-211ENST00000430390 KIF14Q15058 1648 aa18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 GLI2P10070 1586 aa17.99■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 HRCP23327 699 aa17.98■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 CD109Q6YHK3 1445 aa17.97■□□□□ 0.47
TTLL3-211ENST00000430390 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TTLL3-211ENST00000430390 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TTLL3-211ENST00000430390 TSPOAP1O95153 1857 aa17.92■□□□□ 0.46
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