RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TTLL3-210ENST00000427220 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.67■■■□□ 2.18
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TTLL3-210ENST00000427220 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.52■■■□□ 2.16
TTLL3-210ENST00000427220 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.5■■■□□ 2.15
TTLL3-210ENST00000427220 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TTLL3-210ENST00000427220 TOPBP1Q92547 1522 aa28.44■■■□□ 2.14
TTLL3-210ENST00000427220 FBLN2P98095 1184 aa28.42■■■□□ 2.14
TTLL3-210ENST00000427220 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.37■■■□□ 2.13
TTLL3-210ENST00000427220 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TTLL3-210ENST00000427220 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TTLL3-210ENST00000427220 KCNH8Q96L42 1107 aa28.33■■■□□ 2.13
TTLL3-210ENST00000427220 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.33■■■□□ 2.13
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.31■■■□□ 2.12
TTLL3-210ENST00000427220 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.3■■■□□ 2.12
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM52Q96A61 297 aa28.29■■■□□ 2.12
TTLL3-210ENST00000427220 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TTLL3-210ENST00000427220 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.26■■■□□ 2.11
TTLL3-210ENST00000427220 TIAM1Q13009 1591 aa28.23■■■□□ 2.11
TTLL3-210ENST00000427220 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.22■■■□□ 2.11
TTLL3-210ENST00000427220 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.113e-11■■■■■ 47.8
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TTLL3-210ENST00000427220 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.19■■■□□ 2.1
TTLL3-210ENST00000427220 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.18■■■□□ 2.1
TTLL3-210ENST00000427220 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.18■■■□□ 2.1
TTLL3-210ENST00000427220 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TTLL3-210ENST00000427220 FOXD1Q16676 465 aa28.12■■■□□ 2.09
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TTLL3-210ENST00000427220 PRDM2Q13029 1718 aa28.05■■■□□ 2.08
TTLL3-210ENST00000427220 BCANQ96GW7 911 aa28.04■■■□□ 2.08
TTLL3-210ENST00000427220 FMN1Q68DA7 1419 aa28.03■■■□□ 2.08
TTLL3-210ENST00000427220 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.01■■■□□ 2.07
TTLL3-210ENST00000427220 TONSLQ96HA7 1378 aa28.01■■■□□ 2.07
TTLL3-210ENST00000427220 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.95■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 MAPKBP1O60336 1514 aa27.95■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRKQ15262 1439 aa27.92■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.91■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.9■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 WDR97A6NE52 1622 aa27.89■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.89■■■□□ 2.06
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TTLL3-210ENST00000427220 NCOA2Q15596 1464 aa27.86■■■□□ 2.05
TTLL3-210ENST00000427220 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.85■■■□□ 2.05
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.8■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 ERCC6Q03468 1493 aa27.79■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 ANP32CO43423 234 aa27.79■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.78■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 MAP3K1Q13233 1512 aa27.78■■■□□ 2.04
TTLL3-210ENST00000427220 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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TTLL3-210ENST00000427220 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.75■■■□□ 2.03
TTLL3-210ENST00000427220 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.73■■■□□ 2.03
TTLL3-210ENST00000427220 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.69■■■□□ 2.02
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TTLL3-210ENST00000427220 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.67■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.67■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 NAIPQ13075 1403 aa27.65■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.64■■■□□ 2.02
TTLL3-210ENST00000427220 FKBP8Q14318 412 aa27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-210ENST00000427220 GRIN2BQ13224 1484 aa27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-210ENST00000427220 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-210ENST00000427220 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-210ENST00000427220 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.62■■■□□ 2.01
TTLL3-210ENST00000427220 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
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TTLL3-210ENST00000427220 HFM1A2PYH4 1435 aa27.57■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 UACAQ9BZF9 1416 aa27.56■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 JPH4Q96JJ6 628 aa27.56■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 IQGAP2Q13576 1575 aa27.52■■■□□ 2
TTLL3-210ENST00000427220 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.5■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.49■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 SAMD9Q5K651 1589 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.46■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.46■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.45■■□□□ 1.99
TTLL3-210ENST00000427220 NEFLP07196 543 aa27.44■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.983e-6■■■■□ 26.4
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.44■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.984e-8■■□□□ 14.2
TTLL3-210ENST00000427220 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.4■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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