RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423497.5

BUD23-204, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BUD23, Length 1,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-204ENST00000423497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
BUD23-204ENST00000423497 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
BUD23-204ENST00000423497 ADAMTS12P58397 1594 aa22.94■■□□□ 1.26
BUD23-204ENST00000423497 GRIN2AQ12879 1464 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-204ENST00000423497 IGF1RP08069 1367 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-204ENST00000423497 NUP160Q12769 1436 aa22.82■■□□□ 1.24
BUD23-204ENST00000423497 CUL7Q14999 1698 aa22.78■■□□□ 1.24
BUD23-204ENST00000423497 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-204ENST00000423497 CEP170Q5SW79 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
BUD23-204ENST00000423497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.62■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.62■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 EEA1Q15075 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 JPH4Q96JJ6 628 aa22.6■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 SHROOM2Q13796 1616 aa22.58■■□□□ 1.21
BUD23-204ENST00000423497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.58■■□□□ 1.2
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BUD23-204ENST00000423497 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.52■■□□□ 1.2
BUD23-204ENST00000423497 PRXQ9BXM0 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
BUD23-204ENST00000423497 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
BUD23-204ENST00000423497 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
BUD23-204ENST00000423497 IQGAP2Q13576 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
BUD23-204ENST00000423497 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.43■■□□□ 1.18
BUD23-204ENST00000423497 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.4■■□□□ 1.18
BUD23-204ENST00000423497 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
BUD23-204ENST00000423497 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.34■■□□□ 1.17
BUD23-204ENST00000423497 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.33■■□□□ 1.17
BUD23-204ENST00000423497 PTPRGP23470 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
BUD23-204ENST00000423497 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.3■■□□□ 1.16
BUD23-204ENST00000423497 GOLGA3Q08378 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
BUD23-204ENST00000423497 DISP1Q96F81 1524 aa22.27■■□□□ 1.16
BUD23-204ENST00000423497 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.26■■□□□ 1.15
BUD23-204ENST00000423497 KIF21BO75037 1637 aa22.25■■□□□ 1.15
BUD23-204ENST00000423497 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
BUD23-204ENST00000423497 KIAA0556O60303 1618 aa22.21■■□□□ 1.15
BUD23-204ENST00000423497 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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BUD23-204ENST00000423497 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.17■■□□□ 1.14
BUD23-204ENST00000423497 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.16■■□□□ 1.14
BUD23-204ENST00000423497 UACAQ9BZF9 1416 aa22.15■■□□□ 1.14
BUD23-204ENST00000423497 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.14■■□□□ 1.14
BUD23-204ENST00000423497 DIP2BQ9P265 1576 aa22.14■■□□□ 1.13
BUD23-204ENST00000423497 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.14■■□□□ 1.13
BUD23-204ENST00000423497 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.13■■□□□ 1.13
BUD23-204ENST00000423497 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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BUD23-204ENST00000423497 SAMD9Q5K651 1589 aa22.05■■□□□ 1.12
BUD23-204ENST00000423497 KDM6BO15054 1643 aa22.04■■□□□ 1.12
BUD23-204ENST00000423497 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.03■■□□□ 1.12
BUD23-204ENST00000423497 P3H3Q8IVL6 736 aa22.02■■□□□ 1.12
BUD23-204ENST00000423497 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.02■■□□□ 1.12
BUD23-204ENST00000423497 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
BUD23-204ENST00000423497 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.01■■□□□ 1.11
BUD23-204ENST00000423497 PLB1Q6P1J6 1458 aa22■■□□□ 1.11
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BUD23-204ENST00000423497 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.95■■□□□ 1.1
BUD23-204ENST00000423497 ASXL2Q76L83 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
BUD23-204ENST00000423497 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.9■■□□□ 1.1
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BUD23-204ENST00000423497 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.84■■□□□ 1.09
BUD23-204ENST00000423497 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
BUD23-204ENST00000423497 GLI2P10070 1586 aa21.82■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 ATP10BO94823 1461 aa21.81■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 ARID3CA6NKF2 412 aa21.77■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 CLIP1P30622 1438 aa21.77■■□□□ 1.08
BUD23-204ENST00000423497 KCNH8Q96L42 1107 aa21.71■■□□□ 1.07
BUD23-204ENST00000423497 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.7■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.7■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.7■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 ADGRL1O94910 1474 aa21.7■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 HECW1Q76N89 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.68■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 CEP162Q5TB80 1403 aa21.65■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 CD109Q6YHK3 1445 aa21.64■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.64■■□□□ 1.06
BUD23-204ENST00000423497 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.61■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.6■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.59■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.59■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
BUD23-204ENST00000423497 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
BUD23-204ENST00000423497 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.55■■□□□ 1.04
BUD23-204ENST00000423497 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
BUD23-204ENST00000423497 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.53■■□□□ 1.04
BUD23-204ENST00000423497 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.53■■□□□ 1.04
BUD23-204ENST00000423497 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
BUD23-204ENST00000423497 NEO1Q92859 1461 aa21.47■■□□□ 1.03
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