RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422897.6

MTTP-202, Transcript of microsomal triglyceride transfer protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MTTP, Length 1,155 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTP-202ENST00000422897 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.02■□□□□ 0.32
MTTP-202ENST00000422897 EEA1Q15075 1411 aa17.01■□□□□ 0.31
MTTP-202ENST00000422897 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17■□□□□ 0.31
MTTP-202ENST00000422897 GRIN2AQ12879 1464 aa16.99■□□□□ 0.31
MTTP-202ENST00000422897 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.99■□□□□ 0.31
MTTP-202ENST00000422897 OSCARQ8IYS5 282 aa16.97■□□□□ 0.31
MTTP-202ENST00000422897 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.94■□□□□ 0.3
MTTP-202ENST00000422897 CEP170Q5SW79 1584 aa16.91■□□□□ 0.3
MTTP-202ENST00000422897 PRXQ9BXM0 1461 aa16.91■□□□□ 0.3
MTTP-202ENST00000422897 NUP160Q12769 1436 aa16.87■□□□□ 0.29
MTTP-202ENST00000422897 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.85■□□□□ 0.29
MTTP-202ENST00000422897 KIF21BO75037 1637 aa16.85■□□□□ 0.29
MTTP-202ENST00000422897 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 GOLGA3Q08378 1498 aa16.8■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.79■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.79■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.78■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.78■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
MTTP-202ENST00000422897 IQGAP2Q13576 1575 aa16.77■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 JPH4Q96JJ6 628 aa16.74■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 ARHGEF11O15085 1522 aa16.71■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 SHROOM2Q13796 1616 aa16.71■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.71■□□□□ 0.27
MTTP-202ENST00000422897 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.7■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.7■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.7■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.7■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.67■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.65■□□□□ 0.26
MTTP-202ENST00000422897 P3H3Q8IVL6 736 aa16.64■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.62■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 ARAP1Q96P48 1450 aa16.61■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 DISP1Q96F81 1524 aa16.6■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 KIAA0556O60303 1618 aa16.6■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.6■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.59■□□□□ 0.25
MTTP-202ENST00000422897 SAMD9Q5K651 1589 aa16.55■□□□□ 0.24
MTTP-202ENST00000422897 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.54■□□□□ 0.24
MTTP-202ENST00000422897 PTPRGP23470 1445 aa16.53■□□□□ 0.24
MTTP-202ENST00000422897 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.52■□□□□ 0.24
MTTP-202ENST00000422897 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.52■□□□□ 0.24
MTTP-202ENST00000422897 CLIP1P30622 1438 aa16.52■□□□□ 0.23
MTTP-202ENST00000422897 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.51■□□□□ 0.23
MTTP-202ENST00000422897 CEP162Q5TB80 1403 aa16.51■□□□□ 0.23
MTTP-202ENST00000422897 RNF39Q9H2S5 420 aa16.49■□□□□ 0.23
MTTP-202ENST00000422897 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.43■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 ARID3CA6NKF2 412 aa16.43■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 UACAQ9BZF9 1416 aa16.42■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.41■□□□□ 0.22
MTTP-202ENST00000422897 ABCA8O94911 1581 aa16.38■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 ABCC2Q92887 1545 aa16.38■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.37■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 FMN1Q68DA7 1419 aa16.36■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.34■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
MTTP-202ENST00000422897 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 HECW1Q76N89 1606 aa16.3■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.28■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.27■□□□□ 0.2
MTTP-202ENST00000422897 ATP10BO94823 1461 aa16.26■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.26■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.26■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.24■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 ASXL2Q76L83 1435 aa16.23■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
MTTP-202ENST00000422897 MAPKBP1O60336 1514 aa16.2■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 KCNH8Q96L42 1107 aa16.2■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.18■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.17■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.16■□□□□ 0.18
MTTP-202ENST00000422897 APLP2Q06481 763 aa16.14■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.14■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 DIP2BQ9P265 1576 aa16.13■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.12■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.12■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.11■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 TIAM1Q13009 1591 aa16.11■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.1■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.1■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 TSPOAP1O95153 1857 aa16.08■□□□□ 0.17
MTTP-202ENST00000422897 KIF14Q15058 1648 aa16.08■□□□□ 0.16
MTTP-202ENST00000422897 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MTTP-202ENST00000422897 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.04■□□□□ 0.16
MTTP-202ENST00000422897 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.8 ms