RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416248.5

HDAC11-208, Transcript of histone deacetylase 11, human

TSL 4

Gene HDAC11, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC11-208	ENST00000416248	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.13	■■■■□ 3.05
HDAC11-208	ENST00000416248	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.99	■■■■□ 3.03
HDAC11-208	ENST00000416248	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.98	■■■■□ 3.03
HDAC11-208	ENST00000416248	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.94	■■■■□ 3.02
HDAC11-208	ENST00000416248	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.94	■■■■□ 3.02
HDAC11-208	ENST00000416248	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.93	■■■■□ 3.02
HDAC11-208	ENST00000416248	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.9	■■■■□ 3.02
HDAC11-208	ENST00000416248	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.88	■■■■□ 3.01
HDAC11-208	ENST00000416248	CUL7	Q14999	1698 aa		33.83	■■■■□ 3.01
HDAC11-208	ENST00000416248	IGF1R	P08069	1367 aa		33.83	■■■■□ 3.01
HDAC11-208	ENST00000416248	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.79	■■■■□ 3
HDAC11-208	ENST00000416248	KDM6B	O15054	1643 aa		33.71	■■■□□ 2.99
HDAC11-208	ENST00000416248	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.69	■■■□□ 2.98
HDAC11-208	ENST00000416248	PTPRG	P23470	1445 aa		33.63	■■■□□ 2.97
HDAC11-208	ENST00000416248	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.59	■■■□□ 2.97
HDAC11-208	ENST00000416248	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HDAC11-208	ENST00000416248	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HDAC11-208	ENST00000416248	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HDAC11-208	ENST00000416248	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HDAC11-208	ENST00000416248	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
HDAC11-208	ENST00000416248	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HDAC11-208	ENST00000416248	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.45	■■■□□ 2.95
HDAC11-208	ENST00000416248	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.44	■■■□□ 2.94
HDAC11-208	ENST00000416248	GLI2	P10070	1586 aa		33.44	■■■□□ 2.94
HDAC11-208	ENST00000416248	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.44	■■■□□ 2.94
HDAC11-208	ENST00000416248	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
HDAC11-208	ENST00000416248	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HDAC11-208	ENST00000416248	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.37	■■■□□ 2.93
HDAC11-208	ENST00000416248	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HDAC11-208	ENST00000416248	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HDAC11-208	ENST00000416248	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.26	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.25	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.21	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.2	■■■□□ 2.91
HDAC11-208	ENST00000416248	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
HDAC11-208	ENST00000416248	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.18	■■■□□ 2.9
HDAC11-208	ENST00000416248	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.06	■■■□□ 2.88
HDAC11-208	ENST00000416248	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HDAC11-208	ENST00000416248	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
HDAC11-208	ENST00000416248	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HDAC11-208	ENST00000416248	ABCA8	O94911	1581 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HDAC11-208	ENST00000416248	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HDAC11-208	ENST00000416248	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.92	■■■□□ 2.86
HDAC11-208	ENST00000416248	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.9	■■■□□ 2.86
HDAC11-208	ENST00000416248	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.9	■■■□□ 2.86
HDAC11-208	ENST00000416248	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.83	■■■□□ 2.85
HDAC11-208	ENST00000416248	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HDAC11-208	ENST00000416248	KIF21B	O75037	1637 aa		32.7	■■■□□ 2.83
HDAC11-208	ENST00000416248	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.68	■■■□□ 2.82
HDAC11-208	ENST00000416248	ATP10B	O94823	1461 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HDAC11-208	ENST00000416248	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
HDAC11-208	ENST00000416248	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HDAC11-208	ENST00000416248	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.59	■■■□□ 2.81
HDAC11-208	ENST00000416248	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.57	■■■□□ 2.8
HDAC11-208	ENST00000416248	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.55	■■■□□ 2.8
HDAC11-208	ENST00000416248	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HDAC11-208	ENST00000416248	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.5	■■■□□ 2.79
HDAC11-208	ENST00000416248	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HDAC11-208	ENST00000416248	NEO1	Q92859	1461 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HDAC11-208	ENST00000416248	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HDAC11-208	ENST00000416248	PTPRM	P28827	1452 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HDAC11-208	ENST00000416248	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.39	■■■□□ 2.78
HDAC11-208	ENST00000416248	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.39	■■■□□ 2.78
HDAC11-208	ENST00000416248	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
HDAC11-208	ENST00000416248	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
HDAC11-208	ENST00000416248	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
HDAC11-208	ENST00000416248	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.35	■■■□□ 2.77
HDAC11-208	ENST00000416248	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.29	■■■□□ 2.76
HDAC11-208	ENST00000416248	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.26	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.25	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.25	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.23	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	EEA1	Q15075	1411 aa		32.21	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.2	■■■□□ 2.75
HDAC11-208	ENST00000416248	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.19	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.17	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	FANCA	O15360	1455 aa		32.17	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.17	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.16	■■■□□ 2.74
HDAC11-208	ENST00000416248	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HDAC11-208	ENST00000416248	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.11	■■■□□ 2.73
HDAC11-208	ENST00000416248	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.11	■■■□□ 2.73
HDAC11-208	ENST00000416248	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HDAC11-208	ENST00000416248	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HDAC11-208	ENST00000416248	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.04	■■■□□ 2.72
HDAC11-208	ENST00000416248	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HDAC11-208	ENST00000416248	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.01	■■■□□ 2.72
HDAC11-208	ENST00000416248	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
HDAC11-208	ENST00000416248	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HDAC11-208	ENST00000416248	PLCH2	O75038	1416 aa		31.94	■■■□□ 2.7
HDAC11-208	ENST00000416248	HSPA2	P54652	639 aa		31.94	■■■□□ 2.7
HDAC11-208	ENST00000416248	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.93	■■■□□ 2.7
HDAC11-208	ENST00000416248	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.92	■■■□□ 2.7

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