RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FBLN2P98095 1184 aa32.02■■■□□ 2.72
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ODC1-202ENST00000405333 ARAP1Q96P48 1450 aa31.92■■■□□ 2.7
ODC1-202ENST00000405333 CEP170Q5SW79 1584 aa31.89■■■□□ 2.7
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ODC1-202ENST00000405333 IQGAP2Q13576 1575 aa31.85■■■□□ 2.69
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ODC1-202ENST00000405333 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.8■■■□□ 2.68
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.8■■■□□ 2.68
ODC1-202ENST00000405333 NUP160Q12769 1436 aa31.79■■■□□ 2.68
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ODC1-202ENST00000405333 KIAA0556O60303 1618 aa31.54■■■□□ 2.64
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ODC1-202ENST00000405333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.68■■■□□ 2.5
ODC1-202ENST00000405333 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.67■■■□□ 2.5
ODC1-202ENST00000405333 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.65■■■□□ 2.5
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ODC1-202ENST00000405333 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.46■■■□□ 2.47
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ODC1-202ENST00000405333 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
ODC1-202ENST00000405333 PTPRKQ15262 1439 aa30.37■■■□□ 2.45
ODC1-202ENST00000405333 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.36■■■□□ 2.45
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ODC1-202ENST00000405333 PREX2Q70Z35 1606 aa30.34■■■□□ 2.45
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