RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGEF11O15085 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 IQGAP2Q13576 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTBP8-201ENST00000403258 GOLGA3Q08378 1498 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTBP8-201ENST00000403258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTBP8-201ENST00000403258 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTBP8-201ENST00000403258 JPH4Q96JJ6 628 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTBP8-201ENST00000403258 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ARAP1Q96P48 1450 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KIAA0556O60303 1618 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTBP8-201ENST00000403258 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTBP8-201ENST00000403258 DISP1Q96F81 1524 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTBP8-201ENST00000403258 SAMD9Q5K651 1589 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTBP8-201ENST00000403258 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTBP8-201ENST00000403258 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTBP8-201ENST00000403258 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTBP8-201ENST00000403258 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTBP8-201ENST00000403258 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTBP8-201ENST00000403258 PTPRGP23470 1445 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTBP8-201ENST00000403258 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTBP8-201ENST00000403258 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCC2Q92887 1545 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCA8O94911 1581 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 UACAQ9BZF9 1416 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ACTBP8-201ENST00000403258 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 P3H3Q8IVL6 736 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 CLIP1P30622 1438 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 CEP162Q5TB80 1403 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTBP8-201ENST00000403258 FMN1Q68DA7 1419 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTBP8-201ENST00000403258 MAPKBP1O60336 1514 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTBP8-201ENST00000403258 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTBP8-201ENST00000403258 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTBP8-201ENST00000403258 HECW1Q76N89 1606 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTBP8-201ENST00000403258 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
ACTBP8-201ENST00000403258 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ACTBP8-201ENST00000403258 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 ATP10BO94823 1461 aa24.45■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.45■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.45■■□□□ 1.51
ACTBP8-201ENST00000403258 DIP2BQ9P265 1576 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTBP8-201ENST00000403258 ASXL2Q76L83 1435 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTBP8-201ENST00000403258 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.39■■□□□ 1.5
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.39■■□□□ 1.5
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.38■■□□□ 1.49
ACTBP8-201ENST00000403258 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTBP8-201ENST00000403258 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTBP8-201ENST00000403258 GLI2P10070 1586 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTBP8-201ENST00000403258 ARID3CA6NKF2 412 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTBP8-201ENST00000403258 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTBP8-201ENST00000403258 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTBP8-201ENST00000403258 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF14Q15058 1648 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 TIAM1Q13009 1591 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 TSPOAP1O95153 1857 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 MAP3K1Q13233 1512 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
ACTBP8-201ENST00000403258 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 KCNH8Q96L42 1107 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 CD109Q6YHK3 1445 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTBP8-201ENST00000403258 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 PREX2Q70Z35 1606 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTBP8-201ENST00000403258 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 APLP2Q06481 763 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 NEO1Q92859 1461 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 PLCH2O75038 1416 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 KDM6BO15054 1643 aa23.95■■□□□ 1.43
ACTBP8-201ENST00000403258 FANCAO15360 1455 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTBP8-201ENST00000403258 NCOA2Q15596 1464 aa23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.7 ms