RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399599.7

CDIP1-201, Transcript of cell death inducing p53 target 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDIP1, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1-201ENST00000399599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.77■□□□□ 0.92
CDIP1-201ENST00000399599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.73■□□□□ 0.91
CDIP1-201ENST00000399599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.71■□□□□ 0.91
CDIP1-201ENST00000399599 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.7■□□□□ 0.9
CDIP1-201ENST00000399599 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CDIP1-201ENST00000399599 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.63■□□□□ 0.89
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CDIP1-201ENST00000399599 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.62■□□□□ 0.89
CDIP1-201ENST00000399599 ERCC6Q03468 1493 aa20.59■□□□□ 0.89
CDIP1-201ENST00000399599 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CDIP1-201ENST00000399599 NEUROD1Q13562 356 aa20.58■□□□□ 0.88
CDIP1-201ENST00000399599 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CDIP1-201ENST00000399599 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.52■□□□□ 0.88
CDIP1-201ENST00000399599 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.51■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.51■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 TIAM1Q13009 1591 aa20.49■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.48■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.47■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.47■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.47■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
CDIP1-201ENST00000399599 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.44■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 WDR97A6NE52 1622 aa20.4■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.4■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 MIER1Q8N108 512 aa20.4■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 CUL7Q14999 1698 aa20.39■□□□□ 0.86
CDIP1-201ENST00000399599 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.35■□□□□ 0.85
CDIP1-201ENST00000399599 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.35■□□□□ 0.85
CDIP1-201ENST00000399599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.35■□□□□ 0.85
CDIP1-201ENST00000399599 FMN1Q68DA7 1419 aa20.34■□□□□ 0.85
CDIP1-201ENST00000399599 GRIN2BQ13224 1484 aa20.31■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.29■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.27■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 PBRM1Q86U86 1689 aa20.27■□□□□ 0.84
CDIP1-201ENST00000399599 PTPRKQ15262 1439 aa20.26■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 FOXD1Q16676 465 aa20.25■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.25■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 TRIM52Q96A61 297 aa20.25■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 IFT140Q96RY7 1462 aa20.24■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 NCOA2Q15596 1464 aa20.22■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.22■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.22■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.21■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 ADAMTS12P58397 1594 aa20.21■□□□□ 0.83
CDIP1-201ENST00000399599 IQGAP2Q13576 1575 aa20.2■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 JPH4Q96JJ6 628 aa20.19■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 WDR62O43379 1518 aa20.18■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.18■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 SAMD9Q5K651 1589 aa20.17■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 MAP3K1Q13233 1512 aa20.14■□□□□ 0.82
CDIP1-201ENST00000399599 GRIN2AQ12879 1464 aa20.14■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 MAPKBP1O60336 1514 aa20.13■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.12■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 BCL11AQ9H165 835 aa20.09■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 KCNH8Q96L42 1107 aa20.08■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CDIP1-201ENST00000399599 DISP1Q96F81 1524 aa20.08■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.05■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.05■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.04■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.03■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 CEP170Q5SW79 1584 aa20.02■□□□□ 0.8
CDIP1-201ENST00000399599 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 SYNJ2O15056 1496 aa19.98■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 NAIPQ13075 1403 aa19.98■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 KIAA0556O60303 1618 aa19.96■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.96■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.96■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 TONSLQ96HA7 1378 aa19.96■□□□□ 0.79
CDIP1-201ENST00000399599 HECW1Q76N89 1606 aa19.95■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.95■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.92■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 KDM6BO15054 1643 aa19.92■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.91■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 HFM1A2PYH4 1435 aa19.9■□□□□ 0.78
CDIP1-201ENST00000399599 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212.1 ms