RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.36■■□□□ 1.49
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.34■■□□□ 1.49
CHCHD2-201ENST00000395422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.3■■□□□ 1.48
CHCHD2-201ENST00000395422 MAPKBP1O60336 1514 aa24.27■■□□□ 1.48
CHCHD2-201ENST00000395422 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
CHCHD2-201ENST00000395422 DIP2BQ9P265 1576 aa24.24■■□□□ 1.47
CHCHD2-201ENST00000395422 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.23■■□□□ 1.47
CHCHD2-201ENST00000395422 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.2■■□□□ 1.46
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.14■■□□□ 1.45
CHCHD2-201ENST00000395422 IGF1RP08069 1367 aa24.12■■□□□ 1.45
CHCHD2-201ENST00000395422 KDM6BO15054 1643 aa24.11■■□□□ 1.45
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPRGP23470 1445 aa24.02■■□□□ 1.44
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF27Q86VH2 1401 aa24.01■■□□□ 1.43
CHCHD2-201ENST00000395422 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CHCHD2-201ENST00000395422 TSPOAP1O95153 1857 aa24■■□□□ 1.43
CHCHD2-201ENST00000395422 CUL7Q14999 1698 aa23.95■■□□□ 1.43
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCC2Q92887 1545 aa23.94■■□□□ 1.42
CHCHD2-201ENST00000395422 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.93■■□□□ 1.42
CHCHD2-201ENST00000395422 ASXL2Q76L83 1435 aa23.93■■□□□ 1.42
CHCHD2-201ENST00000395422 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.91■■□□□ 1.42
CHCHD2-201ENST00000395422 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CHCHD2-201ENST00000395422 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.87■■□□□ 1.41
CHCHD2-201ENST00000395422 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.87■■□□□ 1.41
CHCHD2-201ENST00000395422 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CHCHD2-201ENST00000395422 GLI2P10070 1586 aa23.86■■□□□ 1.41
CHCHD2-201ENST00000395422 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CHCHD2-201ENST00000395422 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.84■■□□□ 1.41
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CHCHD2-201ENST00000395422 UACAQ9BZF9 1416 aa23.82■■□□□ 1.4
CHCHD2-201ENST00000395422 DISP1Q96F81 1524 aa23.8■■□□□ 1.4
CHCHD2-201ENST00000395422 IQGAP2Q13576 1575 aa23.8■■□□□ 1.4
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CHCHD2-201ENST00000395422 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.75■■□□□ 1.39
CHCHD2-201ENST00000395422 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.7■■□□□ 1.39
CHCHD2-201ENST00000395422 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.68■■□□□ 1.38
CHCHD2-201ENST00000395422 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.66■■□□□ 1.38
CHCHD2-201ENST00000395422 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CHCHD2-201ENST00000395422 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.65■■□□□ 1.38
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA0556O60303 1618 aa23.62■■□□□ 1.37
CHCHD2-201ENST00000395422 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
CHCHD2-201ENST00000395422 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.6■■□□□ 1.37
CHCHD2-201ENST00000395422 CD109Q6YHK3 1445 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD2-201ENST00000395422 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNH8Q96L42 1107 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCA8O94911 1581 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2-201ENST00000395422 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2-201ENST00000395422 GOLGA3Q08378 1498 aa23.39■■□□□ 1.34
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2-201ENST00000395422 ARID3CA6NKF2 412 aa23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2-201ENST00000395422 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2-201ENST00000395422 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.33■■□□□ 1.32
CHCHD2-201ENST00000395422 PRXQ9BXM0 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP10BO94823 1461 aa23.29■■□□□ 1.32
CHCHD2-201ENST00000395422 FBXO41Q8TF61 875 aa23.27■■□□□ 1.32
CHCHD2-201ENST00000395422 P3H3Q8IVL6 736 aa23.25■■□□□ 1.31
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPRMP28827 1452 aa23.24■■□□□ 1.31
CHCHD2-201ENST00000395422 RAPGEF3O95398 923 aa23.24■■□□□ 1.31
CHCHD2-201ENST00000395422 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.2■■□□□ 1.3
CHCHD2-201ENST00000395422 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.19■■□□□ 1.3
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.19■■□□□ 1.3
CHCHD2-201ENST00000395422 NEO1Q92859 1461 aa23.14■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.14■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.1■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 MADDQ8WXG6 1647 aa23.09■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.08■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 SAMD9Q5K651 1589 aa23.08■■□□□ 1.29
CHCHD2-201ENST00000395422 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CHCHD2-201ENST00000395422 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CHCHD2-201ENST00000395422 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.06■■□□□ 1.28
CHCHD2-201ENST00000395422 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 HSPA2P54652 639 aa22.99■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.99■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.98■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 AKNAQ7Z591 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 FANCAO15360 1455 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 RICTORQ6R327 1708 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.264e-16■□□□□ 10.9
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CHCHD2-201ENST00000395422 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 MLECQ14165 292 aa22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 CERKQ8TCT0 537 aa22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 HECW1Q76N89 1606 aa22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.79■■□□□ 1.24
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