RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393637.5

FGFR4-202, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-202ENST00000393637 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.25■■□□□ 1.79
FGFR4-202ENST00000393637 NEUROD1Q13562 356 aa26.22■■□□□ 1.79
FGFR4-202ENST00000393637 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.19■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.17■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.17■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.14■■□□□ 1.78
FGFR4-202ENST00000393637 CUL7Q14999 1698 aa26.13■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 MAP3K1Q13233 1512 aa26.12■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.12■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 MIER1Q8N108 512 aa26.11■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 WDR97A6NE52 1622 aa26.1■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.09■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.08■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.08■■□□□ 1.77
FGFR4-202ENST00000393637 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.07■■□□□ 1.76
FGFR4-202ENST00000393637 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.04■■□□□ 1.76
FGFR4-202ENST00000393637 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.04■■□□□ 1.76
FGFR4-202ENST00000393637 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
FGFR4-202ENST00000393637 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FGFR4-202ENST00000393637 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26■■□□□ 1.75
FGFR4-202ENST00000393637 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26■■□□□ 1.75
FGFR4-202ENST00000393637 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.94■■□□□ 1.74
FGFR4-202ENST00000393637 FMN1Q68DA7 1419 aa25.93■■□□□ 1.74
FGFR4-202ENST00000393637 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.92■■□□□ 1.74
FGFR4-202ENST00000393637 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
FGFR4-202ENST00000393637 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.747e-7■■■■■ 37
FGFR4-202ENST00000393637 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.9■■□□□ 1.74
FGFR4-202ENST00000393637 MAPKBP1O60336 1514 aa25.88■■□□□ 1.73
FGFR4-202ENST00000393637 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.86■■□□□ 1.73
FGFR4-202ENST00000393637 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.85■■□□□ 1.73
FGFR4-202ENST00000393637 SAMD9Q5K651 1589 aa25.84■■□□□ 1.73
FGFR4-202ENST00000393637 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.83■■□□□ 1.73
FGFR4-202ENST00000393637 ARID3CA6NKF2 412 aa25.78■■□□□ 1.72
FGFR4-202ENST00000393637 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.77■■□□□ 1.72
FGFR4-202ENST00000393637 PBRM1Q86U86 1689 aa25.77■■□□□ 1.72
FGFR4-202ENST00000393637 GRIN2BQ13224 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
FGFR4-202ENST00000393637 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.75■■□□□ 1.71
FGFR4-202ENST00000393637 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
FGFR4-202ENST00000393637 NCOA2Q15596 1464 aa25.71■■□□□ 1.71
FGFR4-202ENST00000393637 PTPRKQ15262 1439 aa25.69■■□□□ 1.7
FGFR4-202ENST00000393637 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
FGFR4-202ENST00000393637 ADAMTS12P58397 1594 aa25.66■■□□□ 1.7
FGFR4-202ENST00000393637 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.65■■□□□ 1.7
FGFR4-202ENST00000393637 IQGAP2Q13576 1575 aa25.64■■□□□ 1.7
FGFR4-202ENST00000393637 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.63■■□□□ 1.69
FGFR4-202ENST00000393637 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
FGFR4-202ENST00000393637 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.59■■□□□ 1.69
FGFR4-202ENST00000393637 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.58■■□□□ 1.69
FGFR4-202ENST00000393637 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.58■■□□□ 1.69
FGFR4-202ENST00000393637 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 IFT140Q96RY7 1462 aa25.55■■□□□ 1.68
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FGFR4-202ENST00000393637 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.53■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 HFM1A2PYH4 1435 aa25.53■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.52■■□□□ 1.68
FGFR4-202ENST00000393637 HECW1Q76N89 1606 aa25.51■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 WDR62O43379 1518 aa25.51■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 NAIPQ13075 1403 aa25.5■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 ERCC6Q03468 1493 aa25.49■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 ARHGEF11O15085 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 FBLN2P98095 1184 aa25.46■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FGFR4-202ENST00000393637 KCNH8Q96L42 1107 aa25.44■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 UACAQ9BZF9 1416 aa25.44■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 TONSLQ96HA7 1378 aa25.42■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 DISP1Q96F81 1524 aa25.4■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.4■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.39■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 GRIN2AQ12879 1464 aa25.39■■□□□ 1.66
FGFR4-202ENST00000393637 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
FGFR4-202ENST00000393637 TRIM52Q96A61 297 aa25.38■■□□□ 1.65
FGFR4-202ENST00000393637 KIAA0556O60303 1618 aa25.37■■□□□ 1.65
FGFR4-202ENST00000393637 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FGFR4-202ENST00000393637 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
FGFR4-202ENST00000393637 KDM6BO15054 1643 aa25.33■■□□□ 1.64
FGFR4-202ENST00000393637 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FGFR4-202ENST00000393637 FOXD1Q16676 465 aa25.29■■□□□ 1.64
FGFR4-202ENST00000393637 MIA2Q96PC5 1412 aa25.26■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 CEP170Q5SW79 1584 aa25.25■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.25■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.22■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.21■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 SYNJ2O15056 1496 aa25.21■■□□□ 1.63
FGFR4-202ENST00000393637 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FGFR4-202ENST00000393637 JPH4Q96JJ6 628 aa25.18■■□□□ 1.62
FGFR4-202ENST00000393637 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FGFR4-202ENST00000393637 DAPK1P53355 1430 aa25.18■■□□□ 1.62
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