RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381765.7

HPCAL1-202, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-202ENST00000381765 CLIP1P30622 1438 aa24.93■■□□□ 1.58
HPCAL1-202ENST00000381765 ADAMTS12P58397 1594 aa24.89■■□□□ 1.57
HPCAL1-202ENST00000381765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.82■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 GRIN2AQ12879 1464 aa24.81■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.79■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.78■■□□□ 1.56
HPCAL1-202ENST00000381765 ARHGEF11O15085 1522 aa24.76■■□□□ 1.55
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HPCAL1-202ENST00000381765 ARAP1Q96P48 1450 aa24.71■■□□□ 1.55
HPCAL1-202ENST00000381765 CEP170Q5SW79 1584 aa24.71■■□□□ 1.55
HPCAL1-202ENST00000381765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.55
HPCAL1-202ENST00000381765 NUP160Q12769 1436 aa24.69■■□□□ 1.54
HPCAL1-202ENST00000381765 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.66■■□□□ 1.54
HPCAL1-202ENST00000381765 P3H3Q8IVL6 736 aa24.63■■□□□ 1.53
HPCAL1-202ENST00000381765 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HPCAL1-202ENST00000381765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.56■■□□□ 1.52
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HPCAL1-202ENST00000381765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.53■■□□□ 1.52
HPCAL1-202ENST00000381765 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.53■■□□□ 1.52
HPCAL1-202ENST00000381765 SHROOM2Q13796 1616 aa24.51■■□□□ 1.51
HPCAL1-202ENST00000381765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.5■■□□□ 1.51
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HPCAL1-202ENST00000381765 KIAA0556O60303 1618 aa24.31■■□□□ 1.48
HPCAL1-202ENST00000381765 DISP1Q96F81 1524 aa24.3■■□□□ 1.48
HPCAL1-202ENST00000381765 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HPCAL1-202ENST00000381765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.27■■□□□ 1.48
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HPCAL1-202ENST00000381765 TIAM1Q13009 1591 aa24.24■■□□□ 1.47
HPCAL1-202ENST00000381765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1-202ENST00000381765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.19■■□□□ 1.46
HPCAL1-202ENST00000381765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.18■■□□□ 1.46
HPCAL1-202ENST00000381765 MAP3K1Q13233 1512 aa24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1-202ENST00000381765 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.12■■□□□ 1.45
HPCAL1-202ENST00000381765 ARID3CA6NKF2 412 aa24.12■■□□□ 1.45
HPCAL1-202ENST00000381765 HECW1Q76N89 1606 aa24.11■■□□□ 1.45
HPCAL1-202ENST00000381765 PTPRGP23470 1445 aa24.11■■□□□ 1.45
HPCAL1-202ENST00000381765 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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HPCAL1-202ENST00000381765 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.07■■□□□ 1.44
HPCAL1-202ENST00000381765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HPCAL1-202ENST00000381765 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1-202ENST00000381765 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1-202ENST00000381765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.02■■□□□ 1.44
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HPCAL1-202ENST00000381765 MTUS2Q5JR59 1369 aa24■■□□□ 1.43
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HPCAL1-202ENST00000381765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.94■■□□□ 1.42
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HPCAL1-202ENST00000381765 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HPCAL1-202ENST00000381765 ABCA8O94911 1581 aa23.93■■□□□ 1.42
HPCAL1-202ENST00000381765 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.92■■□□□ 1.42
HPCAL1-202ENST00000381765 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
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HPCAL1-202ENST00000381765 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HPCAL1-202ENST00000381765 MAPKBP1O60336 1514 aa23.88■■□□□ 1.41
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HPCAL1-202ENST00000381765 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.84■■□□□ 1.41
HPCAL1-202ENST00000381765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.81■■□□□ 1.4
HPCAL1-202ENST00000381765 ATP10BO94823 1461 aa23.79■■□□□ 1.4
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HPCAL1-202ENST00000381765 ITGAEP38570 1179 aa23.78■■□□□ 1.4
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HPCAL1-202ENST00000381765 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.78■■□□□ 1.4
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HPCAL1-202ENST00000381765 ASXL2Q76L83 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
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HPCAL1-202ENST00000381765 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.74■■□□□ 1.39
HPCAL1-202ENST00000381765 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.73■■□□□ 1.39
HPCAL1-202ENST00000381765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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HPCAL1-202ENST00000381765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.65■■□□□ 1.38
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HPCAL1-202ENST00000381765 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.62■■□□□ 1.37
HPCAL1-202ENST00000381765 GLI2P10070 1586 aa23.59■■□□□ 1.37
HPCAL1-202ENST00000381765 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HPCAL1-202ENST00000381765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 368.3
HPCAL1-202ENST00000381765 KCNH8Q96L42 1107 aa23.55■■□□□ 1.36
HPCAL1-202ENST00000381765 MIA2Q96PC5 1412 aa23.55■■□□□ 1.36
HPCAL1-202ENST00000381765 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HPCAL1-202ENST00000381765 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.54■■□□□ 1.36
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