RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 CUL7Q14999 1698 aa39.66■■■■□ 3.94
PXDC1-202ENST00000380283 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.66■■■■□ 3.94
PXDC1-202ENST00000380283 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PXDC1-202ENST00000380283 PBRM1Q86U86 1689 aa39.59■■■■□ 3.93
PXDC1-202ENST00000380283 GRIN2BQ13224 1484 aa39.59■■■■□ 3.93
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PXDC1-202ENST00000380283 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
PXDC1-202ENST00000380283 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
PXDC1-202ENST00000380283 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.44■■■■□ 3.9
PXDC1-202ENST00000380283 CLIP1P30622 1438 aa39.43■■■■□ 3.9
PXDC1-202ENST00000380283 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.89
PXDC1-202ENST00000380283 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.36■■■■□ 3.89
PXDC1-202ENST00000380283 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
PXDC1-202ENST00000380283 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.22■■■■□ 3.87
PXDC1-202ENST00000380283 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.18■■■■□ 3.86
PXDC1-202ENST00000380283 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
PXDC1-202ENST00000380283 SYNJ2O15056 1496 aa39.13■■■■□ 3.86
PXDC1-202ENST00000380283 MYT1Q01538 1121 aa39.13■■■■□ 3.85
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.11■■■■□ 3.85
PXDC1-202ENST00000380283 GRIN2AQ12879 1464 aa39.11■■■■□ 3.85
PXDC1-202ENST00000380283 FBLN2P98095 1184 aa39.08■■■■□ 3.85
PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
PXDC1-202ENST00000380283 ARAP1Q96P48 1450 aa39.05■■■■□ 3.84
PXDC1-202ENST00000380283 MIER1Q8N108 512 aa39.03■■■■□ 3.84
PXDC1-202ENST00000380283 P3H3Q8IVL6 736 aa38.92■■■■□ 3.82
PXDC1-202ENST00000380283 IQGAP2Q13576 1575 aa38.91■■■■□ 3.82
PXDC1-202ENST00000380283 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.89■■■■□ 3.82
PXDC1-202ENST00000380283 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.89■■■■□ 3.82
PXDC1-202ENST00000380283 APLP2Q06481 763 aa38.88■■■■□ 3.81
PXDC1-202ENST00000380283 CEP170Q5SW79 1584 aa38.85■■■■□ 3.81
PXDC1-202ENST00000380283 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.85■■■■□ 3.81
PXDC1-202ENST00000380283 NUP160Q12769 1436 aa38.83■■■■□ 3.81
PXDC1-202ENST00000380283 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.8■■■■□ 3.8
PXDC1-202ENST00000380283 SAMD9Q5K651 1589 aa38.79■■■■□ 3.8
PXDC1-202ENST00000380283 CHD1O14646 1710 aa38.74■■■■□ 3.79
PXDC1-202ENST00000380283 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.72■■■■□ 3.79
PXDC1-202ENST00000380283 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
PXDC1-202ENST00000380283 JPH4Q96JJ6 628 aa38.63■■■■□ 3.77
PXDC1-202ENST00000380283 FMN1Q68DA7 1419 aa38.6■■■■□ 3.77
PXDC1-202ENST00000380283 DISP1Q96F81 1524 aa38.57■■■■□ 3.77
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA0556O60303 1618 aa38.51■■■■□ 3.75
PXDC1-202ENST00000380283 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
PXDC1-202ENST00000380283 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.49■■■■□ 3.75
PXDC1-202ENST00000380283 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PXDC1-202ENST00000380283 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
PXDC1-202ENST00000380283 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.44■■■■□ 3.74
PXDC1-202ENST00000380283 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.42■■■■□ 3.74
PXDC1-202ENST00000380283 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
PXDC1-202ENST00000380283 MAP3K1Q13233 1512 aa38.36■■■■□ 3.73
PXDC1-202ENST00000380283 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
PXDC1-202ENST00000380283 TIAM1Q13009 1591 aa38.33■■■■□ 3.73
PXDC1-202ENST00000380283 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.3■■■■□ 3.72
PXDC1-202ENST00000380283 SHROOM2Q13796 1616 aa38.29■■■■□ 3.72
PXDC1-202ENST00000380283 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.21■■■■□ 3.71
PXDC1-202ENST00000380283 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.19■■■■□ 3.7
PXDC1-202ENST00000380283 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.17■■■■□ 3.7
PXDC1-202ENST00000380283 OSCARQ8IYS5 282 aa38.17■■■■□ 3.7
PXDC1-202ENST00000380283 HECW1Q76N89 1606 aa38.16■■■■□ 3.7
PXDC1-202ENST00000380283 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.16■■■■□ 3.7
PXDC1-202ENST00000380283 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.11■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.11■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRGP23470 1445 aa38.09■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.09■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.09■■■■□ 3.69
PXDC1-202ENST00000380283 ARID3CA6NKF2 412 aa38.06■■■■□ 3.68
PXDC1-202ENST00000380283 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
PXDC1-202ENST00000380283 MTUS2Q5JR59 1369 aa38■■■■□ 3.67
PXDC1-202ENST00000380283 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
PXDC1-202ENST00000380283 ABCA8O94911 1581 aa37.97■■■■□ 3.67
PXDC1-202ENST00000380283 MAPKBP1O60336 1514 aa37.94■■■■□ 3.66
PXDC1-202ENST00000380283 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.9■■■■□ 3.66
PXDC1-202ENST00000380283 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.88■■■■□ 3.65
PXDC1-202ENST00000380283 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.86■■■■□ 3.65
PXDC1-202ENST00000380283 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.86■■■■□ 3.65
PXDC1-202ENST00000380283 UACAQ9BZF9 1416 aa37.85■■■■□ 3.65
PXDC1-202ENST00000380283 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
PXDC1-202ENST00000380283 ATP10BO94823 1461 aa37.78■■■■□ 3.64
PXDC1-202ENST00000380283 NCOA2Q15596 1464 aa37.76■■■■□ 3.63
PXDC1-202ENST00000380283 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PXDC1-202ENST00000380283 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.74■■■■□ 3.63
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC2Q92887 1545 aa37.7■■■■□ 3.63
PXDC1-202ENST00000380283 ITGAEP38570 1179 aa37.68■■■■□ 3.62
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF11O15085 1522 aa37.67■■■■□ 3.62
PXDC1-202ENST00000380283 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa37.67■■■■□ 3.62
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.66■■■■□ 3.62
PXDC1-202ENST00000380283 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
PXDC1-202ENST00000380283 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.62■■■■□ 3.61
PXDC1-202ENST00000380283 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.6■■■■□ 3.61
PXDC1-202ENST00000380283 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.58■■■■□ 3.61
PXDC1-202ENST00000380283 KCNH8Q96L42 1107 aa37.57■■■■□ 3.6
PXDC1-202ENST00000380283 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.56■■■■□ 3.6
PXDC1-202ENST00000380283 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
PXDC1-202ENST00000380283 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.49■■■■□ 3.59
PXDC1-202ENST00000380283 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
PXDC1-202ENST00000380283 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.47■■■■□ 3.59
PXDC1-202ENST00000380283 KIF14Q15058 1648 aa37.46■■■■□ 3.59
PXDC1-202ENST00000380283 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms