RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.01■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
SLC25A39-202ENST00000377095 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.95■■■□□ 2.7
SLC25A39-202ENST00000377095 SHROOM2Q13796 1616 aa31.94■■■□□ 2.7
SLC25A39-202ENST00000377095 JPH4Q96JJ6 628 aa31.88■■■□□ 2.69
SLC25A39-202ENST00000377095 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.83■■■□□ 2.69
SLC25A39-202ENST00000377095 ARAP1Q96P48 1450 aa31.8■■■□□ 2.68
SLC25A39-202ENST00000377095 IQGAP2Q13576 1575 aa31.79■■■□□ 2.68
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF21BO75037 1637 aa31.78■■■□□ 2.68
SLC25A39-202ENST00000377095 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
SLC25A39-202ENST00000377095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC25A39-202ENST00000377095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.71■■■□□ 2.67
SLC25A39-202ENST00000377095 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC25A39-202ENST00000377095 DISP1Q96F81 1524 aa31.59■■■□□ 2.65
SLC25A39-202ENST00000377095 GOLGA3Q08378 1498 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC25A39-202ENST00000377095 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC25A39-202ENST00000377095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC25A39-202ENST00000377095 KIAA0556O60303 1618 aa31.5■■■□□ 2.63
SLC25A39-202ENST00000377095 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SLC25A39-202ENST00000377095 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.47■■■□□ 2.63
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPRGP23470 1445 aa31.42■■■□□ 2.62
SLC25A39-202ENST00000377095 SAMD9Q5K651 1589 aa31.39■■■□□ 2.62
SLC25A39-202ENST00000377095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SLC25A39-202ENST00000377095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-202ENST00000377095 P3H3Q8IVL6 736 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC25A39-202ENST00000377095 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC25A39-202ENST00000377095 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.25■■■□□ 2.59
SLC25A39-202ENST00000377095 UACAQ9BZF9 1416 aa31.23■■■□□ 2.59
SLC25A39-202ENST00000377095 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.2■■■□□ 2.59
SLC25A39-202ENST00000377095 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.19■■■□□ 2.58
SLC25A39-202ENST00000377095 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC2Q92887 1545 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-202ENST00000377095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCA8O94911 1581 aa31.15■■■□□ 2.58
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SLC25A39-202ENST00000377095 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.06■■■□□ 2.56
SLC25A39-202ENST00000377095 MAPKBP1O60336 1514 aa31.03■■■□□ 2.56
SLC25A39-202ENST00000377095 CLIP1P30622 1438 aa31.02■■■□□ 2.56
SLC25A39-202ENST00000377095 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.02■■■□□ 2.56
SLC25A39-202ENST00000377095 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
SLC25A39-202ENST00000377095 CEP162Q5TB80 1403 aa30.96■■■□□ 2.55
SLC25A39-202ENST00000377095 FMN1Q68DA7 1419 aa30.95■■■□□ 2.55
SLC25A39-202ENST00000377095 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SLC25A39-202ENST00000377095 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SLC25A39-202ENST00000377095 ATP10BO94823 1461 aa30.9■■■□□ 2.54
SLC25A39-202ENST00000377095 ASXL2Q76L83 1435 aa30.9■■■□□ 2.54
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.87■■■□□ 2.53
SLC25A39-202ENST00000377095 ARID3CA6NKF2 412 aa30.87■■■□□ 2.53
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.86■■■□□ 2.53
SLC25A39-202ENST00000377095 DIP2BQ9P265 1576 aa30.82■■■□□ 2.52
SLC25A39-202ENST00000377095 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.78■■■□□ 2.52
SLC25A39-202ENST00000377095 HECW1Q76N89 1606 aa30.77■■■□□ 2.52
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.77■■■□□ 2.52
SLC25A39-202ENST00000377095 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.76■■■□□ 2.51
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SLC25A39-202ENST00000377095 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.72■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 GLI2P10070 1586 aa30.7■■■□□ 2.51
SLC25A39-202ENST00000377095 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.68■■■□□ 2.5
SLC25A39-202ENST00000377095 KCNH8Q96L42 1107 aa30.64■■■□□ 2.5
SLC25A39-202ENST00000377095 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.62■■■□□ 2.49
SLC25A39-202ENST00000377095 TSPOAP1O95153 1857 aa30.59■■■□□ 2.49
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.58■■■□□ 2.49
SLC25A39-202ENST00000377095 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.58■■■□□ 2.49
SLC25A39-202ENST00000377095 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.57■■■□□ 2.48
SLC25A39-202ENST00000377095 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SLC25A39-202ENST00000377095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.52■■■□□ 2.48
SLC25A39-202ENST00000377095 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.5■■■□□ 2.47
SLC25A39-202ENST00000377095 CD109Q6YHK3 1445 aa30.47■■■□□ 2.47
SLC25A39-202ENST00000377095 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SLC25A39-202ENST00000377095 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.46■■■□□ 2.47
SLC25A39-202ENST00000377095 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.464e-7■■■□□ 16.9
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SLC25A39-202ENST00000377095 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.39■■■□□ 2.46
SLC25A39-202ENST00000377095 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC25A39-202ENST00000377095 TIAM1Q13009 1591 aa30.33■■■□□ 2.45
SLC25A39-202ENST00000377095 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.29■■■□□ 2.44
SLC25A39-202ENST00000377095 MAP3K1Q13233 1512 aa30.29■■■□□ 2.44
SLC25A39-202ENST00000377095 PLCH2O75038 1416 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.24■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM6BO15054 1643 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 NEO1Q92859 1461 aa30.21■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC25A39-202ENST00000377095 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 FANCAO15360 1455 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 PREX2Q70Z35 1606 aa30.14■■■□□ 2.42
SLC25A39-202ENST00000377095 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 AKNAQ7Z591 1439 aa30.13■■■□□ 2.41
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