RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375865.6

CSNK2B-201, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CSNK2B, Length 908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-201ENST00000375865 KIF27Q86VH2 1401 aa25.27■■□□□ 1.64
CSNK2B-201ENST00000375865 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.22■■□□□ 1.63
CSNK2B-201ENST00000375865 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.15■■□□□ 1.62
CSNK2B-201ENST00000375865 CUL7Q14999 1698 aa25.11■■□□□ 1.61
CSNK2B-201ENST00000375865 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.09■■□□□ 1.61
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.08■■□□□ 1.6
CSNK2B-201ENST00000375865 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK2B-201ENST00000375865 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.05■■□□□ 1.6
CSNK2B-201ENST00000375865 MAPKBP1O60336 1514 aa25.05■■□□□ 1.6
CSNK2B-201ENST00000375865 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CSNK2B-201ENST00000375865 PTPRGP23470 1445 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK2B-201ENST00000375865 DIP2BQ9P265 1576 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK2B-201ENST00000375865 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.94■■□□□ 1.58
CSNK2B-201ENST00000375865 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CSNK2B-201ENST00000375865 DISP1Q96F81 1524 aa24.91■■□□□ 1.58
CSNK2B-201ENST00000375865 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CSNK2B-201ENST00000375865 IQGAP2Q13576 1575 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK2B-201ENST00000375865 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK2B-201ENST00000375865 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC2Q92887 1545 aa24.86■■□□□ 1.57
CSNK2B-201ENST00000375865 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.83■■□□□ 1.56
CSNK2B-201ENST00000375865 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.81■■□□□ 1.56
CSNK2B-201ENST00000375865 UACAQ9BZF9 1416 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK2B-201ENST00000375865 ASXL2Q76L83 1435 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK2B-201ENST00000375865 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.73■■□□□ 1.55
CSNK2B-201ENST00000375865 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.73■■□□□ 1.55
CSNK2B-201ENST00000375865 KIAA0556O60303 1618 aa24.7■■□□□ 1.54
CSNK2B-201ENST00000375865 PRXQ9BXM0 1461 aa24.7■■□□□ 1.54
CSNK2B-201ENST00000375865 GLI2P10070 1586 aa24.69■■□□□ 1.54
CSNK2B-201ENST00000375865 KDM6BO15054 1643 aa24.68■■□□□ 1.54
CSNK2B-201ENST00000375865 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.67■■□□□ 1.54
CSNK2B-201ENST00000375865 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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CSNK2B-201ENST00000375865 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CSNK2B-201ENST00000375865 TSPOAP1O95153 1857 aa24.62■■□□□ 1.53
CSNK2B-201ENST00000375865 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCA8O94911 1581 aa24.53■■□□□ 1.52
CSNK2B-201ENST00000375865 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.52■■□□□ 1.52
CSNK2B-201ENST00000375865 GOLGA3Q08378 1498 aa24.51■■□□□ 1.51
CSNK2B-201ENST00000375865 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.51■■□□□ 1.51
CSNK2B-201ENST00000375865 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.5■■□□□ 1.51
CSNK2B-201ENST00000375865 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.46■■□□□ 1.51
CSNK2B-201ENST00000375865 P3H3Q8IVL6 736 aa24.43■■□□□ 1.5
CSNK2B-201ENST00000375865 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.41■■□□□ 1.5
CSNK2B-201ENST00000375865 KCNH8Q96L42 1107 aa24.41■■□□□ 1.5
CSNK2B-201ENST00000375865 CD109Q6YHK3 1445 aa24.38■■□□□ 1.49
CSNK2B-201ENST00000375865 ATP10BO94823 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
CSNK2B-201ENST00000375865 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.37■■□□□ 1.49
CSNK2B-201ENST00000375865 ARID3CA6NKF2 412 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK2B-201ENST00000375865 ADGRL1O94910 1474 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK2B-201ENST00000375865 SAMD9Q5K651 1589 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK2B-201ENST00000375865 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.26■■□□□ 1.47
CSNK2B-201ENST00000375865 EEA1Q15075 1411 aa24.25■■□□□ 1.47
CSNK2B-201ENST00000375865 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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CSNK2B-201ENST00000375865 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.19■■□□□ 1.46
CSNK2B-201ENST00000375865 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.19■■□□□ 1.46
CSNK2B-201ENST00000375865 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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CSNK2B-201ENST00000375865 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK2B-201ENST00000375865 RAPGEF3O95398 923 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK2B-201ENST00000375865 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK2B-201ENST00000375865 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK2B-201ENST00000375865 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK2B-201ENST00000375865 KIF21BO75037 1637 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK2B-201ENST00000375865 NEO1Q92859 1461 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK2B-201ENST00000375865 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK2B-201ENST00000375865 EFCAB5A4FU69 1503 aa24■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.99■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.97■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.43
CSNK2B-201ENST00000375865 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.92■■□□□ 1.42
CSNK2B-201ENST00000375865 AKNAQ7Z591 1439 aa23.92■■□□□ 1.42
CSNK2B-201ENST00000375865 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CSNK2B-201ENST00000375865 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 FANCAO15360 1455 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 PTPRMP28827 1452 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK2B-201ENST00000375865 PLCH2O75038 1416 aa23.83■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 FMN1Q68DA7 1419 aa23.81■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.81■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 RICTORQ6R327 1708 aa23.81■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.79■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.78■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.77■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CSNK2B-201ENST00000375865 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.76■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 MADDQ8WXG6 1647 aa23.74■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.74■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.73■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 HECW1Q76N89 1606 aa23.73■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
CSNK2B-201ENST00000375865 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.7■■□□□ 1.38
CSNK2B-201ENST00000375865 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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