RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
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GTF2E2-201ENST00000355904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
GTF2E2-201ENST00000355904 SYNJ2O15056 1496 aa38.08■■■■□ 3.69
GTF2E2-201ENST00000355904 GRIN2AQ12879 1464 aa38.08■■■■□ 3.69
GTF2E2-201ENST00000355904 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.05■■■■□ 3.68
GTF2E2-201ENST00000355904 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
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GTF2E2-201ENST00000355904 SAMD9Q5K651 1589 aa37.98■■■■□ 3.67
GTF2E2-201ENST00000355904 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
GTF2E2-201ENST00000355904 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.91■■■■□ 3.66
GTF2E2-201ENST00000355904 APLP2Q06481 763 aa37.9■■■■□ 3.66
GTF2E2-201ENST00000355904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.9■■■■□ 3.66
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GTF2E2-201ENST00000355904 CEP170Q5SW79 1584 aa37.84■■■■□ 3.65
GTF2E2-201ENST00000355904 FBLN2P98095 1184 aa37.82■■■■□ 3.64
GTF2E2-201ENST00000355904 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.81■■■■□ 3.64
GTF2E2-201ENST00000355904 NUP160Q12769 1436 aa37.81■■■■□ 3.64
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GTF2E2-201ENST00000355904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
GTF2E2-201ENST00000355904 FMN1Q68DA7 1419 aa37.76■■■■□ 3.64
GTF2E2-201ENST00000355904 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.7■■■■□ 3.63
GTF2E2-201ENST00000355904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.68■■■■□ 3.62
GTF2E2-201ENST00000355904 CHD1O14646 1710 aa37.67■■■■□ 3.62
GTF2E2-201ENST00000355904 MAP3K1Q13233 1512 aa37.67■■■■□ 3.62
GTF2E2-201ENST00000355904 TIAM1Q13009 1591 aa37.62■■■■□ 3.61
GTF2E2-201ENST00000355904 KIAA0556O60303 1618 aa37.62■■■■□ 3.61
GTF2E2-201ENST00000355904 DISP1Q96F81 1524 aa37.61■■■■□ 3.61
GTF2E2-201ENST00000355904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.57■■■■□ 3.61
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GTF2E2-201ENST00000355904 JPH4Q96JJ6 628 aa37.45■■■■□ 3.59
GTF2E2-201ENST00000355904 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.43■■■■□ 3.58
GTF2E2-201ENST00000355904 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.42■■■■□ 3.58
GTF2E2-201ENST00000355904 HECW1Q76N89 1606 aa37.39■■■■□ 3.58
GTF2E2-201ENST00000355904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.37■■■■□ 3.57
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.31■■■■□ 3.56
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GTF2E2-201ENST00000355904 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.55
GTF2E2-201ENST00000355904 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.25■■■■□ 3.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.25■■■■□ 3.55
GTF2E2-201ENST00000355904 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
GTF2E2-201ENST00000355904 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
GTF2E2-201ENST00000355904 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.16■■■■□ 3.54
GTF2E2-201ENST00000355904 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
GTF2E2-201ENST00000355904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.14■■■■□ 3.54
GTF2E2-201ENST00000355904 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
GTF2E2-201ENST00000355904 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.11■■■■□ 3.53
GTF2E2-201ENST00000355904 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.08■■■■□ 3.53
GTF2E2-201ENST00000355904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.07■■■■□ 3.52
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCA8O94911 1581 aa37.06■■■■□ 3.52
GTF2E2-201ENST00000355904 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.05■■■■□ 3.52
GTF2E2-201ENST00000355904 PTPRGP23470 1445 aa37.03■■■■□ 3.52
GTF2E2-201ENST00000355904 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
GTF2E2-201ENST00000355904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37■■■■□ 3.51
GTF2E2-201ENST00000355904 ARID3CA6NKF2 412 aa36.98■■■■□ 3.51
GTF2E2-201ENST00000355904 NCOA2Q15596 1464 aa36.97■■■■□ 3.51
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GTF2E2-201ENST00000355904 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
GTF2E2-201ENST00000355904 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.83■■■■□ 3.49
GTF2E2-201ENST00000355904 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.83■■■■□ 3.49
GTF2E2-201ENST00000355904 UACAQ9BZF9 1416 aa36.83■■■■□ 3.49
GTF2E2-201ENST00000355904 OSCARQ8IYS5 282 aa36.81■■■■□ 3.48
GTF2E2-201ENST00000355904 ATP10BO94823 1461 aa36.79■■■■□ 3.48
GTF2E2-201ENST00000355904 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
GTF2E2-201ENST00000355904 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC2Q92887 1545 aa36.75■■■■□ 3.47
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
GTF2E2-201ENST00000355904 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.71■■■■□ 3.47
GTF2E2-201ENST00000355904 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.65■■■■□ 3.46
GTF2E2-201ENST00000355904 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.64■■■■□ 3.46
GTF2E2-201ENST00000355904 ITGAEP38570 1179 aa36.63■■■■□ 3.46
GTF2E2-201ENST00000355904 MIA2Q96PC5 1412 aa36.62■■■■□ 3.45
GTF2E2-201ENST00000355904 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.61■■■■□ 3.45
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF14Q15058 1648 aa36.61■■■■□ 3.45
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GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.47■■■■□ 3.43
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GTF2E2-201ENST00000355904 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.37■■■■□ 3.41
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GTF2E2-201ENST00000355904 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
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GTF2E2-201ENST00000355904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
GTF2E2-201ENST00000355904 HFM1A2PYH4 1435 aa36.26■■■■□ 3.4
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
GTF2E2-201ENST00000355904 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.26■■■■□ 3.39
GTF2E2-201ENST00000355904 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.39
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GTF2E2-201ENST00000355904 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
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