RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 GRIN2AQ12879 1464 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-201ENST00000351328 CHD1O14646 1710 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 OSCARQ8IYS5 282 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 KIF21BO75037 1637 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 NUP160Q12769 1436 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 GOLGA3Q08378 1498 aa11.02□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 CEP170Q5SW79 1584 aa11.02□□□□□ -0.64
CS-201ENST00000351328 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 BCL11AQ9H165 835 aa11□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 JPH4Q96JJ6 628 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-201ENST00000351328 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 IQGAP2Q13576 1575 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 SHROOM2Q13796 1616 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-201ENST00000351328 HRCP23327 699 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 DISP1Q96F81 1524 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 ARHGEF11O15085 1522 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 SAMD9Q5K651 1589 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 KIAA0556O60303 1618 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-201ENST00000351328 CLIP1P30622 1438 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 CEP162Q5TB80 1403 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 P3H3Q8IVL6 736 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 PTPRGP23470 1445 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 ARAP1Q96P48 1450 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-201ENST00000351328 FMN1Q68DA7 1419 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 UACAQ9BZF9 1416 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 ABCA8O94911 1581 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-201ENST00000351328 ABCC2Q92887 1545 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 HECW1Q76N89 1606 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-201ENST00000351328 ATP10BO94823 1461 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 ARID3CA6NKF2 412 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 MAPKBP1O60336 1514 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-201ENST00000351328 MAP3K1Q13233 1512 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 ASXL2Q76L83 1435 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 TIAM1Q13009 1591 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 KCNH8Q96L42 1107 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.52□□□□□ -0.72
CS-201ENST00000351328 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 GLI2P10070 1586 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 DIP2BQ9P265 1576 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 KIF14Q15058 1648 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.732e-20■□□□□ 10.1
CS-201ENST00000351328 ARXQ96QS3 562 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-201ENST00000351328 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 NCOA2Q15596 1464 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 CD109Q6YHK3 1445 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms