RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-201ENST00000342075 CHD1O14646 1710 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-201ENST00000342075 CLIP1P30622 1438 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-201ENST00000342075 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-201ENST00000342075 P3H3Q8IVL6 736 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-201ENST00000342075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-201ENST00000342075 ARAP1Q96P48 1450 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-201ENST00000342075 IQGAP2Q13576 1575 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-201ENST00000342075 NUP160Q12769 1436 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-201ENST00000342075 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-201ENST00000342075 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-201ENST00000342075 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-201ENST00000342075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-201ENST00000342075 SAMD9Q5K651 1589 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-201ENST00000342075 JPH4Q96JJ6 628 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-201ENST00000342075 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 DISP1Q96F81 1524 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 KIAA0556O60303 1618 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-201ENST00000342075 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-201ENST00000342075 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-201ENST00000342075 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-201ENST00000342075 SHROOM2Q13796 1616 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-201ENST00000342075 OSCARQ8IYS5 282 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-201ENST00000342075 ARID3CA6NKF2 412 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-201ENST00000342075 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 FMN1Q68DA7 1419 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-201ENST00000342075 APLP2Q06481 763 aa21.69■■□□□ 1.06
PMS1-201ENST00000342075 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.69■■□□□ 1.06
PMS1-201ENST00000342075 PTPRGP23470 1445 aa21.65■■□□□ 1.06
PMS1-201ENST00000342075 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PMS1-201ENST00000342075 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.64■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 TIAM1Q13009 1591 aa21.64■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 HECW1Q76N89 1606 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 ABCA8O94911 1581 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-201ENST00000342075 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 ARHGEF11O15085 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-201ENST00000342075 UACAQ9BZF9 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 MAP3K1Q13233 1512 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 ATP10BO94823 1461 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-201ENST00000342075 ABCC2Q92887 1545 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-201ENST00000342075 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-201ENST00000342075 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-201ENST00000342075 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-201ENST00000342075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-201ENST00000342075 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 KIF14Q15058 1648 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 NCOA2Q15596 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.34■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PMS1-201ENST00000342075 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.32■■□□□ 1
PMS1-201ENST00000342075 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PMS1-201ENST00000342075 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.3■■□□□ 1
PMS1-201ENST00000342075 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PMS1-201ENST00000342075 KCNH8Q96L42 1107 aa21.28■■□□□ 1
PMS1-201ENST00000342075 ITGAEP38570 1179 aa21.23■□□□□ 0.99
PMS1-201ENST00000342075 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PMS1-201ENST00000342075 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PMS1-201ENST00000342075 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.21■□□□□ 0.99
PMS1-201ENST00000342075 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.21■□□□□ 0.99
PMS1-201ENST00000342075 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.19■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 ASXL2Q76L83 1435 aa21.19■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.19■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.17■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PMS1-201ENST00000342075 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PMS1-201ENST00000342075 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-201ENST00000342075 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PMS1-201ENST00000342075 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-201ENST00000342075 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 PTPRKQ15262 1439 aa21.04■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 PREX2Q70Z35 1606 aa21.04■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.03■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.03■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.03■□□□□ 0.96
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