RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
SUMO3-201ENST00000332859 ARAP1Q96P48 1450 aa31.49■■■□□ 2.63
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.48■■■□□ 2.63
SUMO3-201ENST00000332859 HRCP23327 699 aa31.38■■■□□ 2.61
SUMO3-201ENST00000332859 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.38■■■□□ 2.61
SUMO3-201ENST00000332859 SYNJ2O15056 1496 aa31.37■■■□□ 2.61
SUMO3-201ENST00000332859 GRIN2AQ12879 1464 aa31.36■■■□□ 2.61
SUMO3-201ENST00000332859 IQGAP2Q13576 1575 aa31.28■■■□□ 2.6
SUMO3-201ENST00000332859 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SUMO3-201ENST00000332859 SAMD9Q5K651 1589 aa31.24■■■□□ 2.59
SUMO3-201ENST00000332859 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.21■■■□□ 2.59
SUMO3-201ENST00000332859 APLP2Q06481 763 aa31.2■■■□□ 2.59
SUMO3-201ENST00000332859 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.18■■■□□ 2.58
SUMO3-201ENST00000332859 FBLN2P98095 1184 aa31.17■■■□□ 2.58
SUMO3-201ENST00000332859 P3H3Q8IVL6 736 aa31.16■■■□□ 2.58
SUMO3-201ENST00000332859 CEP170Q5SW79 1584 aa31.15■■■□□ 2.58
SUMO3-201ENST00000332859 NUP160Q12769 1436 aa31.14■■■□□ 2.57
SUMO3-201ENST00000332859 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.13■■■□□ 2.57
SUMO3-201ENST00000332859 FMN1Q68DA7 1419 aa31.08■■■□□ 2.57
SUMO3-201ENST00000332859 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SUMO3-201ENST00000332859 CHD1O14646 1710 aa31.03■■■□□ 2.56
SUMO3-201ENST00000332859 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.01■■■□□ 2.55
SUMO3-201ENST00000332859 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
SUMO3-201ENST00000332859 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31■■■□□ 2.55
SUMO3-201ENST00000332859 MAP3K1Q13233 1512 aa30.99■■■□□ 2.55
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA0556O60303 1618 aa30.97■■■□□ 2.55
SUMO3-201ENST00000332859 DISP1Q96F81 1524 aa30.95■■■□□ 2.54
SUMO3-201ENST00000332859 TIAM1Q13009 1591 aa30.94■■■□□ 2.54
SUMO3-201ENST00000332859 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.89■■■□□ 2.54
SUMO3-201ENST00000332859 JPH4Q96JJ6 628 aa30.86■■■□□ 2.53
SUMO3-201ENST00000332859 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
SUMO3-201ENST00000332859 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
SUMO3-201ENST00000332859 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.84■■■□□ 2.53
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.78■■■□□ 2.52
SUMO3-201ENST00000332859 HECW1Q76N89 1606 aa30.78■■■□□ 2.52
SUMO3-201ENST00000332859 SHROOM2Q13796 1616 aa30.72■■■□□ 2.51
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.71■■■□□ 2.51
SUMO3-201ENST00000332859 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.71■■■□□ 2.51
SUMO3-201ENST00000332859 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
SUMO3-201ENST00000332859 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
SUMO3-201ENST00000332859 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.68■■■□□ 2.5
SUMO3-201ENST00000332859 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.66■■■□□ 2.5
SUMO3-201ENST00000332859 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
SUMO3-201ENST00000332859 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.58■■■□□ 2.49
SUMO3-201ENST00000332859 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.56■■■□□ 2.48
SUMO3-201ENST00000332859 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
SUMO3-201ENST00000332859 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
SUMO3-201ENST00000332859 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.54■■■□□ 2.48
SUMO3-201ENST00000332859 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SUMO3-201ENST00000332859 ABCA8O94911 1581 aa30.51■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRGP23470 1445 aa30.5■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.47■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.47■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.46■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.45■■■□□ 2.47
SUMO3-201ENST00000332859 ARID3CA6NKF2 412 aa30.42■■■□□ 2.46
SUMO3-201ENST00000332859 NCOA2Q15596 1464 aa30.41■■■□□ 2.46
SUMO3-201ENST00000332859 OSCARQ8IYS5 282 aa30.38■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGEF11O15085 1522 aa30.36■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 UACAQ9BZF9 1416 aa30.34■■■□□ 2.45
SUMO3-201ENST00000332859 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.3■■■□□ 2.44
SUMO3-201ENST00000332859 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.29■■■□□ 2.44
SUMO3-201ENST00000332859 ATP10BO94823 1461 aa30.29■■■□□ 2.44
SUMO3-201ENST00000332859 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SUMO3-201ENST00000332859 ABCC2Q92887 1545 aa30.26■■■□□ 2.44
SUMO3-201ENST00000332859 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.432e-6■■■■■ 39.8
SUMO3-201ENST00000332859 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.21■■■□□ 2.43
SUMO3-201ENST00000332859 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SUMO3-201ENST00000332859 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.2■■■□□ 2.42
SUMO3-201ENST00000332859 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.17■■■□□ 2.42
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.14■■■□□ 2.42
SUMO3-201ENST00000332859 MIA2Q96PC5 1412 aa30.14■■■□□ 2.42
SUMO3-201ENST00000332859 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SUMO3-201ENST00000332859 ITGAEP38570 1179 aa30.12■■■□□ 2.41
SUMO3-201ENST00000332859 KIF14Q15058 1648 aa30.11■■■□□ 2.41
SUMO3-201ENST00000332859 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
SUMO3-201ENST00000332859 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.06■■■□□ 2.4
SUMO3-201ENST00000332859 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.06■■■□□ 2.4
SUMO3-201ENST00000332859 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SUMO3-201ENST00000332859 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30■■■□□ 2.39
SUMO3-201ENST00000332859 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SUMO3-201ENST00000332859 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.92■■■□□ 2.38
SUMO3-201ENST00000332859 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SUMO3-201ENST00000332859 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.91■■■□□ 2.38
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRKQ15262 1439 aa29.89■■■□□ 2.38
SUMO3-201ENST00000332859 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.87■■■□□ 2.37
SUMO3-201ENST00000332859 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.86■■■□□ 2.37
SUMO3-201ENST00000332859 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SUMO3-201ENST00000332859 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.372e-6■■■□□ 14.8
SUMO3-201ENST00000332859 PREX2Q70Z35 1606 aa29.83■■■□□ 2.37
SUMO3-201ENST00000332859 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.82■■■□□ 2.36
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SUMO3-201ENST00000332859 HFM1A2PYH4 1435 aa29.81■■■□□ 2.36
SUMO3-201ENST00000332859 DAPK1P53355 1430 aa29.8■■■□□ 2.36
SUMO3-201ENST00000332859 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.79■■■□□ 2.36
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