RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 KCNH8Q96L42 1107 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB4-201ENST00000332503 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 38.3
HOXB4-201ENST00000332503 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB4-201ENST00000332503 KIF27Q86VH2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.083e-8■■■■□ 19.6
HOXB4-201ENST00000332503 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGEF11O15085 1522 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 SAMD9Q5K651 1589 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 IGF1RP08069 1367 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 HECW1Q76N89 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 NCOA2Q15596 1464 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CCER2I3L3R5 266 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CUL7Q14999 1698 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 MSH5O43196 834 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 BCL11AQ9H165 835 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 PTPRKQ15262 1439 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 HFM1A2PYH4 1435 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 APLP2Q06481 763 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 KDM6BO15054 1643 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 UACAQ9BZF9 1416 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 GRIN2BQ13224 1484 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 NAIPQ13075 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 AKNAQ7Z591 1439 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 FKBP8Q14318 412 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB4-201ENST00000332503 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB4-201ENST00000332503 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.32■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.31■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 E9PCH4 1651 aa21.29■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.27■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 NCOA1Q15788 1441 aa21.27■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.27■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 MBD5Q9P267 1494 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 TOPBP1Q92547 1522 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 FMN1Q68DA7 1419 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 BCANQ96GW7 911 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 PBRM1Q86U86 1689 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 KDM5CP41229 1560 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 NESP48681 1621 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM52Q96A61 297 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 WDR62O43379 1518 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 KIF14Q15058 1648 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 ITGAEP38570 1179 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 ANP32CO43423 234 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC184Q52MB2 194 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 MIA2Q96PC5 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC7Q96M83 1385 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 TONSLQ96HA7 1378 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms