RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316409.2

FAM89B-201, Transcript of family with sequence similarity 89 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM89B, Length 1,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM89B-201ENST00000316409 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.24■■■■■ 4.99
FAM89B-201ENST00000316409 CUL7Q14999 1698 aa46.09■■■■■ 4.97
FAM89B-201ENST00000316409 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.07■■■■■ 4.97
FAM89B-201ENST00000316409 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.05■■■■■ 4.96
FAM89B-201ENST00000316409 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.83■■■■■ 4.93
FAM89B-201ENST00000316409 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.76■■■■■ 4.92
FAM89B-201ENST00000316409 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
FAM89B-201ENST00000316409 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.72■■■■■ 4.91
FAM89B-201ENST00000316409 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.69■■■■■ 4.91
FAM89B-201ENST00000316409 PTPRGP23470 1445 aa45.68■■■■■ 4.9
FAM89B-201ENST00000316409 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.63■■■■■ 4.9
FAM89B-201ENST00000316409 MAPKBP1O60336 1514 aa45.62■■■■■ 4.89
FAM89B-201ENST00000316409 IQGAP2Q13576 1575 aa45.61■■■■■ 4.89
FAM89B-201ENST00000316409 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.61■■■■■ 4.89
FAM89B-201ENST00000316409 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.59■■■■■ 4.89
FAM89B-201ENST00000316409 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.58■■■■■ 4.89
FAM89B-201ENST00000316409 DIP2BQ9P265 1576 aa45.48■■■■■ 4.87
FAM89B-201ENST00000316409 DISP1Q96F81 1524 aa45.45■■■■■ 4.87
FAM89B-201ENST00000316409 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.42■■■■■ 4.86
FAM89B-201ENST00000316409 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
FAM89B-201ENST00000316409 ABCC2Q92887 1545 aa45.35■■■■■ 4.85
FAM89B-201ENST00000316409 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.35■■■■■ 4.85
FAM89B-201ENST00000316409 UACAQ9BZF9 1416 aa45.31■■■■■ 4.84
FAM89B-201ENST00000316409 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.27■■■■■ 4.84
FAM89B-201ENST00000316409 ASXL2Q76L83 1435 aa45.22■■■■■ 4.83
FAM89B-201ENST00000316409 KIAA0556O60303 1618 aa45.21■■■■■ 4.83
FAM89B-201ENST00000316409 TSPOAP1O95153 1857 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM89B-201ENST00000316409 PRXQ9BXM0 1461 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM89B-201ENST00000316409 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.15■■■■■ 4.82
FAM89B-201ENST00000316409 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.09■■■■■ 4.81
FAM89B-201ENST00000316409 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.08■■■■■ 4.81
FAM89B-201ENST00000316409 KDM6BO15054 1643 aa45.04■■■■■ 4.8
FAM89B-201ENST00000316409 GLI2P10070 1586 aa44.99■■■■■ 4.79
FAM89B-201ENST00000316409 GOLGA3Q08378 1498 aa44.98■■■■■ 4.79
FAM89B-201ENST00000316409 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
FAM89B-201ENST00000316409 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.94■■■■■ 4.79
FAM89B-201ENST00000316409 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
FAM89B-201ENST00000316409 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
FAM89B-201ENST00000316409 P3H3Q8IVL6 736 aa44.83■■■■■ 4.77
FAM89B-201ENST00000316409 ABCA8O94911 1581 aa44.81■■■■■ 4.76
FAM89B-201ENST00000316409 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.77■■■■■ 4.76
FAM89B-201ENST00000316409 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.74■■■■■ 4.75
FAM89B-201ENST00000316409 KCNH8Q96L42 1107 aa44.69■■■■■ 4.75
FAM89B-201ENST00000316409 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
FAM89B-201ENST00000316409 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.68■■■■■ 4.74
FAM89B-201ENST00000316409 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
FAM89B-201ENST00000316409 ARID3CA6NKF2 412 aa44.66■■■■■ 4.74
FAM89B-201ENST00000316409 EEA1Q15075 1411 aa44.63■■■■■ 4.74
FAM89B-201ENST00000316409 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.62■■■■■ 4.73
FAM89B-201ENST00000316409 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
FAM89B-201ENST00000316409 CD109Q6YHK3 1445 aa44.53■■■■■ 4.72
FAM89B-201ENST00000316409 SAMD9Q5K651 1589 aa44.52■■■■■ 4.72
FAM89B-201ENST00000316409 ATP10BO94823 1461 aa44.5■■■■■ 4.71
FAM89B-201ENST00000316409 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.43■■■■■ 4.7
FAM89B-201ENST00000316409 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.4■■■■■ 4.7
FAM89B-201ENST00000316409 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.35■■■■■ 4.69
FAM89B-201ENST00000316409 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.33■■■■■ 4.69
FAM89B-201ENST00000316409 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
FAM89B-201ENST00000316409 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.68
FAM89B-201ENST00000316409 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.27■■■■■ 4.68
FAM89B-201ENST00000316409 ADGRL1O94910 1474 aa44.27■■■■■ 4.68
FAM89B-201ENST00000316409 KIF21BO75037 1637 aa44.26■■■■■ 4.68
FAM89B-201ENST00000316409 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
FAM89B-201ENST00000316409 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.13■■■■■ 4.65
FAM89B-201ENST00000316409 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
FAM89B-201ENST00000316409 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.08■■■■■ 4.65
FAM89B-201ENST00000316409 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.07■■■■■ 4.65
FAM89B-201ENST00000316409 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.04■■■■■ 4.64
FAM89B-201ENST00000316409 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.98■■■■■ 4.63
FAM89B-201ENST00000316409 RAPGEF3O95398 923 aa43.98■■■■■ 4.63
FAM89B-201ENST00000316409 NEO1Q92859 1461 aa43.91■■■■■ 4.62
FAM89B-201ENST00000316409 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
FAM89B-201ENST00000316409 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
FAM89B-201ENST00000316409 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.83■■■■■ 4.61
FAM89B-201ENST00000316409 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.78■■■■■ 4.6
FAM89B-201ENST00000316409 FMN1Q68DA7 1419 aa43.75■■■■■ 4.59
FAM89B-201ENST00000316409 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.72■■■■■ 4.59
FAM89B-201ENST00000316409 AKNAQ7Z591 1439 aa43.71■■■■■ 4.59
FAM89B-201ENST00000316409 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.7■■■■■ 4.59
FAM89B-201ENST00000316409 FANCAO15360 1455 aa43.69■■■■■ 4.58
FAM89B-201ENST00000316409 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
FAM89B-201ENST00000316409 HECW1Q76N89 1606 aa43.62■■■■■ 4.57
FAM89B-201ENST00000316409 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.58■■■■■ 4.57
FAM89B-201ENST00000316409 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
FAM89B-201ENST00000316409 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
FAM89B-201ENST00000316409 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.55■■■■■ 4.56
FAM89B-201ENST00000316409 PLCH2O75038 1416 aa43.53■■■■■ 4.56
FAM89B-201ENST00000316409 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.53■■■■■ 4.56
FAM89B-201ENST00000316409 RICTORQ6R327 1708 aa43.53■■■■■ 4.56
FAM89B-201ENST00000316409 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.48■■■■■ 4.55
FAM89B-201ENST00000316409 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.45■■■■■ 4.55
FAM89B-201ENST00000316409 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.44■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 PTPRMP28827 1452 aa43.43■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 KIF14Q15058 1648 aa43.41■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.4■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.4■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.39■■■■■ 4.54
FAM89B-201ENST00000316409 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.37■■■■■ 4.53
FAM89B-201ENST00000316409 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.37■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms