RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 FBLN2P98095 1184 aa33.03■■■□□ 2.88
PACSIN3-201ENST00000298838 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD1O14646 1710 aa32.98■■■□□ 2.87
PACSIN3-201ENST00000298838 IQGAP2Q13576 1575 aa32.94■■■□□ 2.86
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP170Q5SW79 1584 aa32.94■■■□□ 2.86
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP160Q12769 1436 aa32.92■■■□□ 2.86
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.91■■■□□ 2.86
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.89■■■□□ 2.86
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.87■■■□□ 2.85
PACSIN3-201ENST00000298838 ARAP1Q96P48 1450 aa32.81■■■□□ 2.84
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD9Q5K651 1589 aa32.79■■■□□ 2.84
PACSIN3-201ENST00000298838 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.76■■■□□ 2.84
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.75■■■□□ 2.83
PACSIN3-201ENST00000298838 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.66■■■□□ 2.82
PACSIN3-201ENST00000298838 P3H3Q8IVL6 736 aa32.65■■■□□ 2.82
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0556O60303 1618 aa32.61■■■□□ 2.81
PACSIN3-201ENST00000298838 DISP1Q96F81 1524 aa32.6■■■□□ 2.81
PACSIN3-201ENST00000298838 JPH4Q96JJ6 628 aa32.6■■■□□ 2.81
PACSIN3-201ENST00000298838 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.59■■■□□ 2.81
PACSIN3-201ENST00000298838 SHROOM2Q13796 1616 aa32.55■■■□□ 2.8
PACSIN3-201ENST00000298838 FMN1Q68DA7 1419 aa32.55■■■□□ 2.8
PACSIN3-201ENST00000298838 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.53■■■□□ 2.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
PACSIN3-201ENST00000298838 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
PACSIN3-201ENST00000298838 OSCARQ8IYS5 282 aa32.42■■■□□ 2.78
PACSIN3-201ENST00000298838 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.42■■■□□ 2.78
PACSIN3-201ENST00000298838 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.41■■■□□ 2.78
PACSIN3-201ENST00000298838 APLP2Q06481 763 aa32.4■■■□□ 2.78
PACSIN3-201ENST00000298838 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.28■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 HECW1Q76N89 1606 aa32.28■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K1Q13233 1512 aa32.27■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
PACSIN3-201ENST00000298838 TIAM1Q13009 1591 aa32.26■■■□□ 2.75
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.25■■■□□ 2.75
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.24■■■□□ 2.75
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRGP23470 1445 aa32.21■■■□□ 2.75
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.21■■■□□ 2.75
PACSIN3-201ENST00000298838 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.18■■■□□ 2.74
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.17■■■□□ 2.74
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA8O94911 1581 aa32.15■■■□□ 2.74
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
PACSIN3-201ENST00000298838 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
PACSIN3-201ENST00000298838 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.09■■■□□ 2.73
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PACSIN3-201ENST00000298838 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC2Q92887 1545 aa31.98■■■□□ 2.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID3CA6NKF2 412 aa31.98■■■□□ 2.71
PACSIN3-201ENST00000298838 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.96■■■□□ 2.71
PACSIN3-201ENST00000298838 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.96■■■□□ 2.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF11O15085 1522 aa31.93■■■□□ 2.7
PACSIN3-201ENST00000298838 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.92■■■□□ 2.7
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.91■■■□□ 2.7
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP10BO94823 1461 aa31.89■■■□□ 2.69
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PACSIN3-201ENST00000298838 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.84■■■□□ 2.69
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.82■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.78■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 NCOA2Q15596 1464 aa31.77■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
PACSIN3-201ENST00000298838 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.74■■■□□ 2.67
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.72■■■□□ 2.67
PACSIN3-201ENST00000298838 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF14Q15058 1648 aa31.66■■■□□ 2.66
PACSIN3-201ENST00000298838 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.62■■■□□ 2.65
PACSIN3-201ENST00000298838 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.62■■■□□ 2.65
PACSIN3-201ENST00000298838 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.57■■■□□ 2.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.56■■■□□ 2.64
PACSIN3-201ENST00000298838 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
PACSIN3-201ENST00000298838 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.53■■■□□ 2.64
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.51■■■□□ 2.64
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.51■■■□□ 2.63
PACSIN3-201ENST00000298838 MIA2Q96PC5 1412 aa31.49■■■□□ 2.63
PACSIN3-201ENST00000298838 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.46■■■□□ 2.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ASXL2Q76L83 1435 aa31.46■■■□□ 2.63
PACSIN3-201ENST00000298838 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.45■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.42■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH8Q96L42 1107 aa31.41■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
PACSIN3-201ENST00000298838 PREX2Q70Z35 1606 aa31.37■■■□□ 2.61
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPKBP1O60336 1514 aa31.37■■■□□ 2.61
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.36■■■□□ 2.61
PACSIN3-201ENST00000298838 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.31■■■□□ 2.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.3■■■□□ 2.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGAEP38570 1179 aa31.29■■■□□ 2.6
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