RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.04■□□□□ 0.64
RPUSD4-201ENST00000298317 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.04■□□□□ 0.64
RPUSD4-201ENST00000298317 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.03■□□□□ 0.64
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIM52Q96A61 297 aa19.01■□□□□ 0.63
RPUSD4-201ENST00000298317 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19■□□□□ 0.63
RPUSD4-201ENST00000298317 MAP3K1Q13233 1512 aa19■□□□□ 0.63
RPUSD4-201ENST00000298317 ANP32CO43423 234 aa18.98■□□□□ 0.63
RPUSD4-201ENST00000298317 TIAM1Q13009 1591 aa18.97■□□□□ 0.63
RPUSD4-201ENST00000298317 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.95■□□□□ 0.62
RPUSD4-201ENST00000298317 KIF27Q86VH2 1401 aa18.93■□□□□ 0.62
RPUSD4-201ENST00000298317 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.88■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 CUX1P39880 1505 aa18.88■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.88■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.86■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
RPUSD4-201ENST00000298317 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.81■□□□□ 0.6
RPUSD4-201ENST00000298317 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.81■□□□□ 0.6
RPUSD4-201ENST00000298317 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
RPUSD4-201ENST00000298317 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 TONSLQ96HA7 1378 aa18.72■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.71■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RPUSD4-201ENST00000298317 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.7■□□□□ 0.58
RPUSD4-201ENST00000298317 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
RPUSD4-201ENST00000298317 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.66■□□□□ 0.58
RPUSD4-201ENST00000298317 IGF1RP08069 1367 aa18.66■□□□□ 0.58
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.63■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 UACAQ9BZF9 1416 aa18.63■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 HMGXB3Q12766 1538 aa18.62■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 CFTRP13569 1480 aa18.6■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 NCOA2Q15596 1464 aa18.6■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 HFM1A2PYH4 1435 aa18.59■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.59■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.58■□□□□ 0.57
RPUSD4-201ENST00000298317 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.58■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.57■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.57■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.56■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.55■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 NCAPD3P42695 1498 aa18.54■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.54■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.564e-7■■■□□ 18.4
RPUSD4-201ENST00000298317 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.53■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.53■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.53■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 PTPRKQ15262 1439 aa18.52■□□□□ 0.56
RPUSD4-201ENST00000298317 PRDM2Q13029 1718 aa18.51■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC184Q52MB2 194 aa18.5■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.5■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 NAIPQ13075 1403 aa18.49■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.48■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 NBR1Q14596 966 aa18.47■□□□□ 0.55
RPUSD4-201ENST00000298317 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 P3H3Q8IVL6 736 aa18.43■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 NCOA1Q15788 1441 aa18.43■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 FMN1Q68DA7 1419 aa18.43■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.41■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 HECW1Q76N89 1606 aa18.4■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC7Q96M83 1385 aa18.4■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 MRS2Q9HD23 443 aa18.4■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.39■□□□□ 0.54
RPUSD4-201ENST00000298317 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.38■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.37■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.36■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.36■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.35■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.35■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 AKNAQ7Z591 1439 aa18.33■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
RPUSD4-201ENST00000298317 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.33■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.31■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 NUDCQ9Y266 331 aa18.29■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.28■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.27■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
RPUSD4-201ENST00000298317 ARHGEF11O15085 1522 aa18.27■□□□□ 0.51
RPUSD4-201ENST00000298317 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.26■□□□□ 0.51
RPUSD4-201ENST00000298317 CUL7Q14999 1698 aa18.26■□□□□ 0.51
RPUSD4-201ENST00000298317 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.26■□□□□ 0.51
RPUSD4-201ENST00000298317 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.25■□□□□ 0.51
RPUSD4-201ENST00000298317 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms