RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.43□□□□□ -0.42
HERC3-201ENST00000264345 TRIM52Q96A61 297 aa12.42□□□□□ -0.42
HERC3-201ENST00000264345 IGF1RP08069 1367 aa12.41□□□□□ -0.42
HERC3-201ENST00000264345 FMN1Q68DA7 1419 aa12.41□□□□□ -0.42
HERC3-201ENST00000264345 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.39□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.39□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.38□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K1Q13233 1512 aa12.37□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.33□□□□□ -0.43
HERC3-201ENST00000264345 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 TIAM1Q13009 1591 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 CCER2I3L3R5 266 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-201ENST00000264345 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 PRDM2Q13029 1718 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 33.8
HERC3-201ENST00000264345 CUL7Q14999 1698 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 FKBP8Q14318 412 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
HERC3-201ENST00000264345 BCANQ96GW7 911 aa12.21□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 TOPBP1Q92547 1522 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-201ENST00000264345 UACAQ9BZF9 1416 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 ARID3CA6NKF2 412 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 FBLN2P98095 1184 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 NCOA2Q15596 1464 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 HFM1A2PYH4 1435 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
HERC3-201ENST00000264345 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 HECW1Q76N89 1606 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 TSPY4P0CV99 314 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 TSPY10P0CW01 314 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 MRS2Q9HD23 443 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 MIA2Q96PC5 1412 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 NESP48681 1621 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 MAPKBP1O60336 1514 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.02□□□□□ -0.48
HERC3-201ENST00000264345 GRIN2BQ13224 1484 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 WDR97A6NE52 1622 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 ERCC6Q03468 1493 aa12□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.99□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.98□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 IFT140Q96RY7 1462 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 NAIPQ13075 1403 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 IQGAP2Q13576 1575 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.96□□□□□ -0.49
HERC3-201ENST00000264345 AKNAQ7Z591 1439 aa11.96□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 TMC1Q8TDI8 760 aa11.95□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.95□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.95□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.94□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 ROCK1Q13464 1354 aa11.93□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 KCNH8Q96L42 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms