RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 PBRM1Q86U86 1689 aa19.04■□□□□ 0.64
SNX1-201ENST00000261889 EEA1Q15075 1411 aa19.03■□□□□ 0.64
SNX1-201ENST00000261889 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SNX1-201ENST00000261889 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
SNX1-201ENST00000261889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SNX1-201ENST00000261889 GOLGA3Q08378 1498 aa19.01■□□□□ 0.63
SNX1-201ENST00000261889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.98■□□□□ 0.63
SNX1-201ENST00000261889 KIF21BO75037 1637 aa18.96■□□□□ 0.63
SNX1-201ENST00000261889 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.94■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 CUL7Q14999 1698 aa18.94■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 KIF27Q86VH2 1401 aa18.93■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 PRXQ9BXM0 1461 aa18.91■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SNX1-201ENST00000261889 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.88■□□□□ 0.61
SNX1-201ENST00000261889 ADAMTS12P58397 1594 aa18.87■□□□□ 0.61
SNX1-201ENST00000261889 IGF1RP08069 1367 aa18.87■□□□□ 0.61
SNX1-201ENST00000261889 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.84■□□□□ 0.61
SNX1-201ENST00000261889 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
SNX1-201ENST00000261889 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.82■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 GRIN2BQ13224 1484 aa18.82■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.67e-7■■■■■ 31.9
SNX1-201ENST00000261889 TRIM52Q96A61 297 aa18.81■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.8■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 P3H3Q8IVL6 736 aa18.79■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 FKBP8Q14318 412 aa18.79■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SNX1-201ENST00000261889 MYT1Q01538 1121 aa18.76■□□□□ 0.59
SNX1-201ENST00000261889 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SNX1-201ENST00000261889 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.71■□□□□ 0.59
SNX1-201ENST00000261889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.71■□□□□ 0.59
SNX1-201ENST00000261889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.71■□□□□ 0.59
SNX1-201ENST00000261889 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SNX1-201ENST00000261889 CHD1O14646 1710 aa18.68■□□□□ 0.58
SNX1-201ENST00000261889 SYNJ2O15056 1496 aa18.67■□□□□ 0.58
SNX1-201ENST00000261889 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.66■□□□□ 0.58
SNX1-201ENST00000261889 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SNX1-201ENST00000261889 GRIN2AQ12879 1464 aa18.63■□□□□ 0.57
SNX1-201ENST00000261889 CEP170Q5SW79 1584 aa18.62■□□□□ 0.57
SNX1-201ENST00000261889 NUP160Q12769 1436 aa18.6■□□□□ 0.57
SNX1-201ENST00000261889 ARAP1Q96P48 1450 aa18.58■□□□□ 0.57
SNX1-201ENST00000261889 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.58■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 SHROOM2Q13796 1616 aa18.56■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.55■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.55■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.55■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 SAMD9Q5K651 1589 aa18.53■□□□□ 0.56
SNX1-201ENST00000261889 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.51■□□□□ 0.55
SNX1-201ENST00000261889 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.48■□□□□ 0.55
SNX1-201ENST00000261889 IQGAP2Q13576 1575 aa18.48■□□□□ 0.55
SNX1-201ENST00000261889 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.47■□□□□ 0.55
SNX1-201ENST00000261889 NEFLP07196 543 aa18.45■□□□□ 0.54
SNX1-201ENST00000261889 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SNX1-201ENST00000261889 BCL11AQ9H165 835 aa18.43■□□□□ 0.54
SNX1-201ENST00000261889 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.42■□□□□ 0.54
SNX1-201ENST00000261889 ARID3CA6NKF2 412 aa18.4■□□□□ 0.54
SNX1-201ENST00000261889 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.37■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 DISP1Q96F81 1524 aa18.37■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.37■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 KIAA0556O60303 1618 aa18.36■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 ANP32CO43423 234 aa18.36■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.35■□□□□ 0.53
SNX1-201ENST00000261889 MAPKBP1O60336 1514 aa18.32■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 MSH5O43196 834 aa18.32■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.3■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SNX1-201ENST00000261889 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.26■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.26■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 CCDC184Q52MB2 194 aa18.25■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 FOXD1Q16676 465 aa18.24■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.23■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.23■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.22■□□□□ 0.51
SNX1-201ENST00000261889 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.21■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.19■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 TONSLQ96HA7 1378 aa18.18■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.17■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.16■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 ABCA8O94911 1581 aa18.16■□□□□ 0.5
SNX1-201ENST00000261889 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SNX1-201ENST00000261889 MAP3K1Q13233 1512 aa18.13■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 JPH4Q96JJ6 628 aa18.12■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.11■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.1■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 NBR1Q14596 966 aa18.1■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 FBLN2P98095 1184 aa18.1■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.09■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.08■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 OSCARQ8IYS5 282 aa18.08■□□□□ 0.49
SNX1-201ENST00000261889 FMN1Q68DA7 1419 aa18.08■□□□□ 0.48
SNX1-201ENST00000261889 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.07■□□□□ 0.48
SNX1-201ENST00000261889 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SNX1-201ENST00000261889 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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