RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SLC25A39-201ENST00000225308 SHROOM2Q13796 1616 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC25A39-201ENST00000225308 IQGAP2Q13576 1575 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF21BO75037 1637 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC25A39-201ENST00000225308 JPH4Q96JJ6 628 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ARAP1Q96P48 1450 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC25A39-201ENST00000225308 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SLC25A39-201ENST00000225308 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA3Q08378 1498 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC25A39-201ENST00000225308 DISP1Q96F81 1524 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC25A39-201ENST00000225308 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A39-201ENST00000225308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0556O60303 1618 aa35.76■■■■□ 3.32
SLC25A39-201ENST00000225308 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
SLC25A39-201ENST00000225308 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMD9Q5K651 1589 aa35.64■■■■□ 3.3
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPRGP23470 1445 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC25A39-201ENST00000225308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.51■■■■□ 3.27
SLC25A39-201ENST00000225308 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC25A39-201ENST00000225308 P3H3Q8IVL6 736 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC25A39-201ENST00000225308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC25A39-201ENST00000225308 UACAQ9BZF9 1416 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCC2Q92887 1545 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCA8O94911 1581 aa35.34■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.32■■■■□ 3.25
SLC25A39-201ENST00000225308 CLIP1P30622 1438 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC25A39-201ENST00000225308 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC25A39-201ENST00000225308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC25A39-201ENST00000225308 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
SLC25A39-201ENST00000225308 MAPKBP1O60336 1514 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP162Q5TB80 1403 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC25A39-201ENST00000225308 FMN1Q68DA7 1419 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
SLC25A39-201ENST00000225308 ASXL2Q76L83 1435 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP10BO94823 1461 aa35.03■■■■□ 3.2
SLC25A39-201ENST00000225308 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-201ENST00000225308 ARID3CA6NKF2 412 aa34.99■■■■□ 3.19
SLC25A39-201ENST00000225308 DIP2BQ9P265 1576 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A39-201ENST00000225308 HECW1Q76N89 1606 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC25A39-201ENST00000225308 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.92■■■■□ 3.18
SLC25A39-201ENST00000225308 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
SLC25A39-201ENST00000225308 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SLC25A39-201ENST00000225308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
SLC25A39-201ENST00000225308 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SLC25A39-201ENST00000225308 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
SLC25A39-201ENST00000225308 GLI2P10070 1586 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC25A39-201ENST00000225308 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNH8Q96L42 1107 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.7■■■■□ 3.14
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPOAP1O95153 1857 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC25A39-201ENST00000225308 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.64■■■■□ 3.14
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.62■■■■□ 3.13
SLC25A39-201ENST00000225308 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.58■■■■□ 3.13
SLC25A39-201ENST00000225308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
SLC25A39-201ENST00000225308 CD109Q6YHK3 1445 aa34.53■■■■□ 3.12
SLC25A39-201ENST00000225308 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.124e-7■■■□□ 16.9
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SLC25A39-201ENST00000225308 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.51■■■■□ 3.12
SLC25A39-201ENST00000225308 TIAM1Q13009 1591 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.44■■■■□ 3.1
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K1Q13233 1512 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-201ENST00000225308 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-201ENST00000225308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.37■■■■□ 3.09
SLC25A39-201ENST00000225308 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC25A39-201ENST00000225308 KDM6BO15054 1643 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-201ENST00000225308 PLCH2O75038 1416 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-201ENST00000225308 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.26■■■■□ 3.08
SLC25A39-201ENST00000225308 NEO1Q92859 1461 aa34.26■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.26■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.25■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 FANCAO15360 1455 aa34.24■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 PREX2Q70Z35 1606 aa34.24■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.23■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SLC25A39-201ENST00000225308 APLP2Q06481 763 aa34.19■■■■□ 3.06
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