RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220847.8

PHF20L1-201, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PHF20L1, Length 3,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-201ENST00000220847 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 TOPBP1Q92547 1522 aa25.61■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.61■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 TIAM1Q13009 1591 aa25.6■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.6■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.59■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.58■■□□□ 1.69
PHF20L1-201ENST00000220847 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
PHF20L1-201ENST00000220847 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.57■■□□□ 1.68
PHF20L1-201ENST00000220847 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.57■■□□□ 1.68
PHF20L1-201ENST00000220847 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.51■■□□□ 1.67
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PHF20L1-201ENST00000220847 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.49■■□□□ 1.67
PHF20L1-201ENST00000220847 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.47■■□□□ 1.67
PHF20L1-201ENST00000220847 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PHF20L1-201ENST00000220847 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
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PHF20L1-201ENST00000220847 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.38■■□□□ 1.65
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PHF20L1-201ENST00000220847 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.33■■□□□ 1.65
PHF20L1-201ENST00000220847 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.33■■□□□ 1.65
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PHF20L1-201ENST00000220847 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.31■■□□□ 1.64
PHF20L1-201ENST00000220847 CUL7Q14999 1698 aa25.31■■□□□ 1.64
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PHF20L1-201ENST00000220847 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.3■■□□□ 1.64
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PHF20L1-201ENST00000220847 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.29■■□□□ 1.64
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PHF20L1-201ENST00000220847 KCNH8Q96L42 1107 aa25.19■■□□□ 1.62
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PHF20L1-201ENST00000220847 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.15■■□□□ 1.62
PHF20L1-201ENST00000220847 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.14■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.14■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.12■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 TONSLQ96HA7 1378 aa25.1■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 NCOA2Q15596 1464 aa25.09■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 TRIM52Q96A61 297 aa25.08■■□□□ 1.61
PHF20L1-201ENST00000220847 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
PHF20L1-201ENST00000220847 PTPRKQ15262 1439 aa25.07■■□□□ 1.6
PHF20L1-201ENST00000220847 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.06■■□□□ 1.6
PHF20L1-201ENST00000220847 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.03■■□□□ 1.6
PHF20L1-201ENST00000220847 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
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PHF20L1-201ENST00000220847 GRIN2BQ13224 1484 aa25.01■■□□□ 1.59
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PHF20L1-201ENST00000220847 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.97■■□□□ 1.59
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PHF20L1-201ENST00000220847 FBLN2P98095 1184 aa24.94■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 NAIPQ13075 1403 aa24.93■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 UACAQ9BZF9 1416 aa24.92■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.92■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 ANP32CO43423 234 aa24.9■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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PHF20L1-201ENST00000220847 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.9■■□□□ 1.58
PHF20L1-201ENST00000220847 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
PHF20L1-201ENST00000220847 IQGAP2Q13576 1575 aa24.88■■□□□ 1.57
PHF20L1-201ENST00000220847 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PHF20L1-201ENST00000220847 FOXD1Q16676 465 aa24.88■■□□□ 1.57
PHF20L1-201ENST00000220847 PBRM1Q86U86 1689 aa24.87■■□□□ 1.57
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PHF20L1-201ENST00000220847 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PHF20L1-201ENST00000220847 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.83■■□□□ 1.57
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PHF20L1-201ENST00000220847 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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PHF20L1-201ENST00000220847 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PHF20L1-201ENST00000220847 IFT140Q96RY7 1462 aa24.7■■□□□ 1.55
PHF20L1-201ENST00000220847 FKBP8Q14318 412 aa24.69■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 WDR62O43379 1518 aa24.68■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 ARHGEF11O15085 1522 aa24.68■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.67■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 KDM6BO15054 1643 aa24.66■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PHF20L1-201ENST00000220847 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.64■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 CCER2I3L3R5 266 aa24.64■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 MIA2Q96PC5 1412 aa24.63■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 NEFLP07196 543 aa24.61■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 DISP1Q96F81 1524 aa24.59■■□□□ 1.53
PHF20L1-201ENST00000220847 GRIN2AQ12879 1464 aa24.59■■□□□ 1.53
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