RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kif21aQ9QXL2 1672 aa23.22■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 SynmQ70IV5 1561 aa23.21■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Trim11-201ENSMUST00000093061 Crocc2F6XLV1 1638 aa23.18■■□□□ 1.3
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mrc2Q64449 1479 aa23.18■■□□□ 1.3
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cux1P53564 1515 aa23.18■■□□□ 1.3
Trim11-201ENSMUST00000093061 Naip1Q9QWK5 1403 aa23.13■■□□□ 1.29
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slx4Q6P1D7 1565 aa23.12■■□□□ 1.29
Trim11-201ENSMUST00000093061 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trim11-201ENSMUST00000093061 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Trim11-201ENSMUST00000093061 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rad54l2Q99NG0 1466 aa23.06■■□□□ 1.28
Trim11-201ENSMUST00000093061 BlmO88700 1416 aa23.05■■□□□ 1.28
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sall2Q9QX96 1004 aa23.04■■□□□ 1.28
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.04■■□□□ 1.28
Trim11-201ENSMUST00000093061 Peg3Q3URU2 1571 aa23.01■■□□□ 1.27
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23■■□□□ 1.27
Trim11-201ENSMUST00000093061 CntlnA2AM05 1397 aa23■■□□□ 1.27
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rpap1Q80TE0 1409 aa22.97■■□□□ 1.27
Trim11-201ENSMUST00000093061 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa22.96■■□□□ 1.27
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pla2r1Q62028 1487 aa22.93■■□□□ 1.26
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kdm5bQ80Y84 1544 aa22.92■■□□□ 1.26
Trim11-201ENSMUST00000093061 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.9■■□□□ 1.26
Trim11-201ENSMUST00000093061 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Trim11-201ENSMUST00000093061 TonslQ6NZL6 1363 aa22.9■■□□□ 1.26
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.88■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.88■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.86■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Grin2aP35436 1464 aa22.86■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abca5Q8K448 1642 aa22.85■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Aebp1Q640N1 1128 aa22.85■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.83■■□□□ 1.25
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wdr66E9Q743 1299 aa22.79■■□□□ 1.24
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
Trim11-201ENSMUST00000093061 WizO88286 1684 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Trim11-201ENSMUST00000093061 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.78■■□□□ 1.24
Trim11-201ENSMUST00000093061 Adamts12Q811B3 1600 aa22.77■■□□□ 1.24
Trim11-201ENSMUST00000093061 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 CadpsQ80TJ1 1355 aa22.76■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa22.75■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpatch8A2A6A1 1505 aa22.72■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Trim11-201ENSMUST00000093061 ClspnQ80YR7 1315 aa22.7■■□□□ 1.22
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ift140E9PY46 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abca16E9PWJ7 1678 aa22.67■■□□□ 1.22
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.66■■□□□ 1.22
Trim11-201ENSMUST00000093061 Eid3Q3V124 375 aa22.66■■□□□ 1.22
Trim11-201ENSMUST00000093061 Soga1E1U8D0 1418 aa22.64■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.63■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 PxdnQ3UQ28 1475 aa22.62■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.62■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa22.62■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.61■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gcc2Q8CHG3 1679 aa22.6■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa22.59■■□□□ 1.21
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.56■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccer2J3QPU5 274 aa22.56■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.56■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Csrnp3P59055 597 aa22.55■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Naip2Q9QUK4 1447 aa22.55■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 NexmifQ5DTT1 1515 aa22.55■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 BC005561E9Q5E2 1589 aa22.54■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 A2mQ6GQT1 1474 aa22.54■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Trim11-201ENSMUST00000093061 WrnO09053 1401 aa22.48■■□□□ 1.19
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa22.47■■□□□ 1.19
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.47■■□□□ 1.19
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.46■■□□□ 1.19
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.45■■□□□ 1.18
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abcc2Q8VI47 1543 aa22.44■■□□□ 1.18
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap27A2AB59 869 aa22.4■■□□□ 1.18
Trim11-201ENSMUST00000093061 Aplp2Q06335 707 aa22.4■■□□□ 1.18
Trim11-201ENSMUST00000093061 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.38■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mug1P28665 1476 aa22.38■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 UacaQ8CGB3 1411 aa22.37■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rusc2Q80U22 1514 aa22.36■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Chic2Q9D9G3 165 aa22.36■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa22.35■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgef11Q68FM7 1552 aa22.35■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ncoa3O09000 1398 aa22.34■■□□□ 1.17
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa22.33■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cul7Q8VE73 1689 aa22.32■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fhod3Q76LL6 1578 aa22.3■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ube2uB1AUC4 352 aa22.29■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Map3k4O08648 1597 aa22.27■■□□□ 1.16
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rfx7F8VPJ6 1459 aa22.26■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.25■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa22.25■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.24■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Adcy10Q8C0T9 1614 aa22.24■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa22.23■■□□□ 1.15
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