RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020251.9

Gnptab-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gnptab, Length 5,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rgl3Q3UYI5 709 aa24.67■■□□□ 1.54
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.65■■□□□ 1.54
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Arhgap27A2AB59 869 aa24.62■■□□□ 1.53
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Calr4Q3TQS0 420 aa24.62■■□□□ 1.53
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Gnptab-201ENSMUST00000020251 ArxO35085 564 aa24.54■■□□□ 1.52
Gnptab-201ENSMUST00000020251 P3h3Q8CG70 732 aa24.52■■□□□ 1.52
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa24.49■■□□□ 1.51
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Aplp2Q06335 707 aa24.42■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Kdm2aP59997 1161 aa24.42■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa24.39■■□□□ 1.5
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Mtus2Q3UHD3 1353 aa24.37■■□□□ 1.49
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Card11Q8CIS0 1159 aa24.32■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 IqubQ8CDK3 788 aa24.32■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Mia2Q91ZV0 1396 aa24.27■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.27■■□□□ 1.48
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Gm20521D3Z5F7 333 aa24.25■■□□□ 1.47
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Trim26Q99PN3 545 aa24.24■■□□□ 1.47
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Ofd1Q80Z25 1017 aa24.24■■□□□ 1.47
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Fgd1P52734 960 aa24.22■■□□□ 1.47
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Fmn1Q05860 1466 aa24.21■■□□□ 1.47
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cep162Q6ZQ06 1403 aa24.19■■□□□ 1.46
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Kif27Q7M6Z4 1394 aa24.18■■□□□ 1.46
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Stk24Q99KH8 431 aa24.14■■□□□ 1.45
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.11■■□□□ 1.45
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Aebp1Q640N1 1128 aa24.11■■□□□ 1.45
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Map4P27546 1125 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Stag3O70576 1240 aa24.02■■□□□ 1.44
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Trim30dE9PWL0 497 aa24.01■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Irx6Q9ER75 438 aa24.01■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Pkd2O35245 966 aa24■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa23.99■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 CftrP26361 1476 aa23.98■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Neurod2Q62414 383 aa23.98■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.96■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Apbb1Q9QXJ1 710 aa23.96■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cux2P70298 1426 aa23.95■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 AknaQ80VW7 1404 aa23.95■■□□□ 1.43
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Arid3cA6PWV5 409 aa23.95■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rpap1Q80TE0 1409 aa23.93■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.92■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 CanxP35564 591 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 MyclP10166 368 aa23.92■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cabp1Q9JLK7 227 aa23.91■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 NgefQ8CHT1 710 aa23.91■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.88■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 CntlnA2AM05 1397 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cnga1P29974 684 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Trak1Q6PD31 939 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.87■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rundc1Q0VDN7 615 aa23.85■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Zfp777B9EKF4 885 aa23.83■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Lemd3Q9WU40 921 aa23.83■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Iqcf3Q9D498 203 aa23.82■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Gm6268A2A3U9 297 aa23.8■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Mphosph9A6H5Y1 991 aa23.8■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa23.79■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Vsig10D3YX43 558 aa23.77■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 NudcO35685 332 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Carmil1Q6EDY6 1374 aa23.75■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Fhad1A6PWD2 1420 aa23.74■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa23.74■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa23.73■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa23.73■■□□□ 1.39
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.68■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Stk26Q99JT2 416 aa23.67■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.67■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Fam71e1A1L3C1 212 aa23.65■■□□□ 1.38
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.64■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Tmf1B9EKI3 1091 aa23.64■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Rwdd1Q9CQK7 243 aa23.63■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Exoc6Q8R313 802 aa23.63■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Kif3bQ61771 747 aa23.62■■□□□ 1.37
Gnptab-201ENSMUST00000020251 Dbr1Q923B1 550 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.5 ms