RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV1-46P01743 117 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 Q8N2B8 174 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 Q96MF0 132 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 MED14OSP0DP75 135 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00315P59091 139 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 APC2O95996 2303 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 TRBV12-3P01733 135 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 CTSGP08311 255 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 Q9HAA7 133 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 NDUFB3O43676 98 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 CCKP06307 115 aa8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 PIEZO1Q92508 2521 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 RNF5Q99942 180 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-241ENST00000640511 AKAP13Q12802 2813 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 A8MZ25 164 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 M0R1B8 84 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 MGAQ8IWI9 3026 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 GNRH2O43555 120 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 IGF1P05019 195 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 CACNA1GO43497 2377 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 A0A087WWL8 130 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 CD164Q04900 197 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 F8WEM9 126 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 SOCS3O14543 225 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV1-47P01700 117 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 CD28P10747 220 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 SNURFQ9Y675 71 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 KLKP1Q107X0 134 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 RMI2Q96E14 147 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 IGF2RP11717 2491 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-241ENST00000640511 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 POLEQ07864 2286 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 NDUFA1O15239 70 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 ENHOQ6UWT2 76 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 MUC4Q99102 2169 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 SAA4P35542 130 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 PRR15Q8IV56 129 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 ZZEF1O43149 2961 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 COX7A1P24310 79 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 U3KQE9 123 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-241ENST00000640511 PAX4O43316 350 aa8.56□□□□□ -1.04
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