RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611169.1

5S_rRNA.15-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 127 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 COX8AP10176 69 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CCL18P55774 89 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.88□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PLXNB2O15031 1838 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PARP14Q460N5 1801 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TACC2O95359 2948 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 A0A1W2PRE2 83 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 M0R135 149 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PPP1R17O96001 155 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SYNMO15061 1565 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.89□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MRC1P22897 1456 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 UBE2G1P62253 170 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TRIQKQ629K1 86 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MYH2Q9UKX2 1941 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 DAPK1P53355 1430 aa-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 HTTP42858 3142 aa-0.91□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ERCC6Q03468 1493 aa-0.91□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 H0YGG7 62 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MT-ND4LP03901 98 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SCIMPQ6UWF3 145 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 USMG5Q96IX5 58 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 V9GYH0 126 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.91□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ROCK1Q13464 1354 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 APOC3P02656 99 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CBLN1P23435 193 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SAMD13Q5VXD3 122 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CHMP6Q96FZ7 201 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 GID8Q9NWU2 228 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PXDNQ92626 1479 aa-0.92□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PKD1P98161 4303 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PITX3O75364 302 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MT1AP04731 61 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 IL5P05113 134 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 S100A5P33763 92 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TPPP2P59282 170 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 NCS1P62166 190 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CCL8P80075 99 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 AQP10Q96PS8 301 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.93□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 UQCR11O14957 56 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 ARPC5O15511 151 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SSSCA1O60232 199 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SNCGO76070 127 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 CMPK1P30085 196 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 C10orf128Q5T292 105 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 Q6AWC8 147 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.94□□□□□ -2.56
5S_rRNA.15-201ENST00000611169 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms