RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CARD19Q96LW7 228 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 AP1S3Q96PC3 154 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 CNFNQ9BYD5 112 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 A6NDN8 102 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS1P07477 247 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01559Q495D7 138 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 U3KQE9 123 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf118A6NHY6 69 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EQG2 157 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf48Q96LS8 159 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BRM9 83 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TAL2Q16559 108 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZQT7 251 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 PRO0628Q9UI54 55 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FCER1GP30273 86 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 XGP55808 180 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 J3QR89 54 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EP34 96 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf78Q9BR46 151 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RHODO00212 210 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01620Q4KN68 170 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf173Q96LM9 149 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM126AQ9H061 195 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YWU9 116 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 MALP21145 153 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 XCL2Q9UBD3 114 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 J3KT08 172 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 GCSHP23434 173 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RBAKDNA6NC62 111 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 PRM2P04554 102 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01546A6NGU7 62 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKCP01834 107 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZUT4 128 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC7Q8TAX7 377 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 CDIP1Q9H305 208 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FXYD2P54710 66 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 Q8N8P6 123 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf92Q96LL3 132 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf195Q5TG92 126 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BVH4 76 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRY2O43597 315 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 K7ERJ3 54 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 DPM2O94777 84 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 APOC4P55056 127 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 NRACQ8N912 160 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 KIR2DL4Q99706 377 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPM0 123 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EMI3 77 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 CASC10Q5T4H9 136 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR9Q5T870 116 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5LO75964 103 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 LAGE3Q14657 143 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SYT8Q8NBV8 401 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SOCS3O14543 225 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM13P0DJ93 91 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 FABP2P12104 132 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 HIGD1BQ9P298 99 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BMM0 161 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BS24 57 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.7 ms