RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1S3Q96PC3 154 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLPIP03973 132 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CHTF8P0CG12 524 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SRP19P09132 144 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WYN8 130 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM250H0YL14 139 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QY20 66 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 C9JQL5 133 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE6DO43924 150 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MGPP08493 103 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA4Q8TDM5 124 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC11CQ9BY50 192 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 F8W036 122 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 P01737 135 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf91Q5T1B1 145 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH3Q96FX2 82 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF185Q96GF1 192 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GZMBP10144 247 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM243Q9BU79 118 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TPPP3Q9BW30 176 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUV1 79 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLC6P0CF74 106 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCYAP1P18509 176 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf52Q96A22 123 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C1H1 209 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PHOX2AO14813 284 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TNXBP22105 4242 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP2P98164 4655 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RASL11AQ6T310 242 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf56Q8N910 161 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 APOC3P02656 99 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPGP53567 150 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SVBPQ8N300 66 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF213Q63HN8 5207 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF727A8MUV8 499 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG7P62955 275 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPWQ5EE01 88 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR73Q6P4I2 378 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM7Q9BQ49 75 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 COX6A2Q02221 97 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf33Q8WU49 177 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2L6O14933 153 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAPINO95295 136 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AMTP48728 403 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NIT2Q9NQR4 276 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ODF1Q14990 250 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HIGD2BQ4VC39 106 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT8Q9UHE5 227 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 COTL1Q14019 142 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01600Q96MT4 127 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MAJINQ3KP22 176 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGC1P0CF51 173 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP161Q6P656 301 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 GTSF1Q8WW33 167 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-211ENST00000590874 F2Z2F3 143 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NTF3P20783 257 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RHEBQ15382 184 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 STPG4Q8N801 248 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 XKRY2A2RUG3 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG4P50150 75 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM12Q96EX1 92 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A096LNI7 61 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GATD1Q8NB37 220 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CTRLP40313 264 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ADIRFQ15847 76 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01551Q86U37 167 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YXV3 536 aa16■□□□□ 0.15
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