RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRYBA4P53673 196 aa11.95□□□□□ -0.5
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.95□□□□□ -0.5
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLL5B9A064 214 aa11.94□□□□□ -0.5
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMR3AQ99954 134 aa11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOTCH2Q04721 2471 aa11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPAN13O95857 204 aa11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM238C9JI98 176 aa11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOMO95445 188 aa11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFC1BP0CG36 223 aa11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFC1P0CG37 223 aa11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.78□□□□□ -0.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0J9YXY3 114 aa11.78□□□□□ -0.52
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