RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 Q8NAQ8 132 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TOMM6Q96B49 74 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12BA1L429 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE7O76087 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1D1O95968 90 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12FP0CL80 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12GP0CL81 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12IP0CL82 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FHL2Q14192 279 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NUDT3O95989 172 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TSHBP01222 138 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DKK2Q9UBU2 259 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NACAE9PAV3 2078 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 K7EQD1 137 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 LINC01545Q5VT33 79 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 ERASQ7Z444 233 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 C20orf202A1L168 122 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NPSP0C0P6 89 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 P0DMU3 169 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FAM231AP0DMU4 169 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FAM231CP0DMU5 169 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 S100A12P80511 92 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 IGIPA6NJ69 53 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 UBE2D3P61077 147 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 UBE2D2P62837 147 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TMEM141Q96I45 108 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TIMM17AQ99595 171 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 Q9UF83 564 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 EMP1P54849 157 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 RETNQ9HD89 108 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 DNAH2Q9P225 4427 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 HSPG2P98160 4391 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 LINC00694P0DN24 101 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 DEFB130BP0DP73 79 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 DEFB130AP0DP74 79 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 CRYBA4P53673 196 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PRO0255Q9UI72 69 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 COTL1Q14019 142 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 ATP5G1P05496 136 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PRSS1P07477 247 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 DAD1P61803 113 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PKIAP61925 76 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 ODF1Q14990 250 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WX48 190 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GVY2 172 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 H7C423 109 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZN92 141 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 VAMP8Q9BV40 100 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 BAALCQ8WXS3 180 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12JA6NER3 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 H3BNG1 76 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DEFB4AO15263 64 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE1Q13065 139 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.9 ms