RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEA15Q15121 130 aa11.25□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2L6O14933 153 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCR2O95944 276 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMTP48728 403 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.24□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.2□□□□□ -0.62
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CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM101Q96IK0 257 aa11.11□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYCBP2O75592 4640 aa11.1□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-211ENST00000567434 HBBP68871 147 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP161Q6P656 301 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCXQ7RTU7 201 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIR2DL4Q99706 377 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 hDV102S1A0JD36 115 aa11.07□□□□□ -0.64
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