RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525358.1

EDRF1-210, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene EDRF1, Length 436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-210ENST00000525358 LELP1Q5T871 98 aa7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 NUP35Q8NFH5 326 aa7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 FRZBQ92765 325 aa7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 M0QY20 66 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 MT-ND6P03923 174 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 FABP4P15090 132 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 UBE2D3P61077 147 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 UBE2D2P62837 147 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 K7EP13 123 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DDTP30046 118 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 RASL11AQ6T310 242 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.5□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 PHOX2AO14813 284 aa7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 NACAE9PAV3 2078 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 A0A1B0GW15 77 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 C6orf223Q8N319 242 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 KMT2AQ03164 3969 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 IFITM10A6NMD0 228 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 GATD1Q8NB37 220 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH2Q9P225 4427 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-210ENST00000525358 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 RAB4AP20338 218 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 CAMPP49913 170 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 RTL8CO15255 209 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV3-30P01768 117 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV3-33P01772 117 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 ESDP10768 282 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 AMN1Q8IY45 258 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 MRAP2Q96G30 205 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 RNF185Q96GF1 192 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM262E9PQX1 116 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 NFE4Q86UQ8 179 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 A0A087WX48 190 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 PPP1R17O96001 155 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 HLA-DQA1P01909 254 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 HBBP68871 147 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 Q0VG73 95 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 NIT1Q86X76 327 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 C14orf144Q96I85 54 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 A0A1B0GXF2 115 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 COTL1Q14019 142 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 ST20Q9HBF5 79 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 I3L3M4 83 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 GAS8-AS1O95177 125 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 PMCHP20382 165 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 M0R143 59 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 NCR2O95944 276 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 SCGB1D1O95968 90 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 CKS2P33552 79 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 LAGE3Q14657 143 aa7.4□□□□□ -1.22
EDRF1-210ENST00000525358 C20orf202A1L168 122 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-210ENST00000525358 SMKR1H3BMG3 65 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-210ENST00000525358 VCYO14598 125 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-210ENST00000525358 PPBPP02775 128 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-210ENST00000525358 AMTP48728 403 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms