RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514886.1

PRMT9-204, Transcript of protein arginine methyltransferase 9, human

TSL 2

Gene PRMT9, Length 2,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT9-204	ENST00000514886	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	NPC2	P61916	151 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	NDUFA4	O00483	81 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	ACYP1	P07311	99 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PRMT9-204	ENST00000514886	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	ATP5J2	P56134	94 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	NRGN	Q92686	78 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	CENPE	Q02224	2701 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	NDUFA7	O95182	113 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	CD28	P10747	220 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	SAA4	P35542	130 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	UQCRQ	O14949	82 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	PRB1	P04280	392 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	LINC00643	Q86TS7	51 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886		A8MZ25	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRMT9-204	ENST00000514886	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	TIMM17B	O60830	172 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	HERVK_113	P63121	156 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	NPFF	O15130	113 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	ATP5G1	P05496	136 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	DAND5	Q8N907	189 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	POLQ	O75417	2590 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	COX7A2L	O14548	114 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT9-204	ENST00000514886	C5orf38	Q86SI9	138 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	CXCL5	P42830	114 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886		J3KT08	172 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886		A0A1B0GX51	115 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	COX7C	P15954	63 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	EDN2	P20800	178 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	C5orf47	Q569G3	176 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	NDUFA1	O15239	70 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	C2orf48	Q96LS8	159 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	IGHG2	P01859	326 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	LMO4	P61968	165 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	FBN2	P35556	2912 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PRMT9-204	ENST00000514886	TRAC	P01848	142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRMT9-204	ENST00000514886	C22orf24	Q9Y442	160 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRMT9-204	ENST00000514886	CRYGA	P11844	174 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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