RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482660.1

EML4-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 4, human

TSL 4

Gene EML4, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML4-208	ENST00000482660	SLPI	P03973	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	NTF3	P20783	257 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	CTRL	P40313	264 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	AMT	P48728	403 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	COTL1	Q14019	142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	UBE2L6	O14933	153 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EML4-208	ENST00000482660	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	SULT1A2	P50226	295 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660		Q6ZRU5	148 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660		A0A087WYN8	130 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	BCL2	P10415	239 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	C15orf56	Q8N910	161 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	TWIST1	Q15672	202 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660		K7EN84	100 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	NCR2	O95944	276 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660		Q6ZNX1	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EML4-208	ENST00000482660	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	COX6A2	Q02221	97 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660		H7C423	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	PHOX2A	O14813	284 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	C7orf33	Q8WU49	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	APCS	P02743	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	FGF6	P10767	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	FOXI1	Q12951	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EML4-208	ENST00000482660	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660		I3L3M4	83 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	STPG4	Q8N801	248 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660		A0A096LNI7	61 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660		A8MWL6	223 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	PMCH	P20382	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	XCL1	P47992	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	ESD	P10768	282 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	CCL25	O15444	150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	TSHB	P01222	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	CT83	Q5H943	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EML4-208	ENST00000482660	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EML4-208	ENST00000482660	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EML4-208	ENST00000482660	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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