RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 CRPP02741 224 aa9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 RAB4AP20338 218 aa9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 Q0VG73 95 aa9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 RMI2Q96E14 147 aa9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 COX11Q9Y6N1 276 aa9.32□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 LECT2O14960 151 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 AMTP48728 403 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 PRR34Q9NV39 138 aa9.31□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 MIAQ16674 131 aa9.3□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 MRAP2Q96G30 205 aa9.3□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.3□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GUV1 79 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 SMKR1H3BMG3 65 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 NCR2O95944 276 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 ADCYAP1P18509 176 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 BAALCQ8WXS3 180 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.29□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GW15 77 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GXF2 115 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 UBE2L6O14933 153 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 APCSP02743 223 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 CAMPP49913 170 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-1P60331 282 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 NRACQ8N912 160 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 ST20Q9HBF5 79 aa9.28□□□□□ -0.92
SRRT-210ENST00000477529 I3L3M4 83 aa9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 TSHBP01222 138 aa9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 REG3AQ06141 175 aa9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.27□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 PPP1R2P9O14990 202 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 HLA-DQA1P01909 254 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 GCSHP23434 173 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 HBBP68871 147 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 UQCC3Q6UW78 93 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.26□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 PMCHP20382 165 aa9.25□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.25□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 H7C423 109 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 S100A8P05109 93 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 ESDP10768 282 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.24□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 TMEM218A2RU14 115 aa9.23□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 PPP1R17O96001 155 aa9.23□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 MT-ND4LP03901 98 aa9.23□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 FGF6P10767 208 aa9.23□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 COMMD7Q86VX2 200 aa9.23□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 LINC00862A6NCI5 91 aa9.22□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 F8W036 122 aa9.22□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.22□□□□□ -0.93
SRRT-210ENST00000477529 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 D6R8Y8 96 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 USP17L23D6RBM5 183 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 CKS2P33552 79 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 XGP55808 180 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.21□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 VCYO14598 125 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 TNFRSF6BO95407 300 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 NPYP01303 97 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 C14orf177Q52M58 125 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 SEC11CQ9BY50 192 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 FAT1Q14517 4588 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.2□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 LINC01620Q4KN68 170 aa9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 C20orf78Q9BR46 151 aa9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.19□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 PHOX2AO14813 284 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 PPBPP02775 128 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 FCER1GP30273 86 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZSA8 131 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 Q8N1X5 172 aa9.18□□□□□ -0.94
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