RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A1B0GUV1	79 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	AMT	P48728	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	COTL1	Q14019	142 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	hDV102S1	A0JD36	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310		K7EN84	100 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	PANO1	I0J062	215 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	OXT	P01178	125 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CEBPG	P53567	150 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310		Q6ZNX1	250 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPH3	Q96FX2	82 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	NCR2	O95944	276 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310		A8MWL6	223 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	APCS	P02743	223 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CFAP161	Q6P656	301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLPI	P03973	132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310		H7C423	109 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	C15orf56	Q8N910	161 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHTF8	P0CG12	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	FGF6	P10767	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	PMCH	P20382	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CT83	Q5H943	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310		I3L3M4	83 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A087WYN8	130 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A1B0GUT8	65 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	GAS8-AS1	O95177	125 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	COX6A2	Q02221	97 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	TSHB	P01222	138 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	XCL1	P47992	114 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	FOXI1	Q12951	378 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	ESD	P10768	282 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAJIN	Q3KP22	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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