RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 R4GN34 69 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BQF6 201 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TPPP2P59282 170 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 ANK2Q01484 3957 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 COLCA2A8K830 154 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TFF3Q07654 80 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 CATR1Q13166 79 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 PP632Q6XCG6 107 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 C10orf111Q8N326 155 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 NABP2Q9BQ15 211 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC11CQ9BY50 192 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 RERGLQ9H628 205 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID1AO14497 2285 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 RBP4P02753 201 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM258P61165 79 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK6Q00534 326 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 ATOH7Q8N100 152 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N814 137 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 HIVEP2P31629 2446 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 LYRM1O43325 122 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 PITX3O75364 302 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV1-51P01701 117 aa2.72□□□□□ -1.97
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RABGGTB-204ENST00000461653 HSD52Q0P140 79 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 Q6ZUT4 128 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB106AQ8N104 65 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 OR5AS1Q8N127 324 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.72□□□□□ -1.97
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RABGGTB-204ENST00000461653 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-204ENST00000461653 AKAP6Q13023 2319 aa2.72□□□□□ -1.97
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RABGGTB-204ENST00000461653 OR51F1A6NGY5 319 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 M0R233 179 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 TRACP01848 142 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PMP2P02689 132 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 CKS2P33552 79 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 ROMO1P60602 79 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 S100A10P60903 97 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 MIC13Q5XKP0 118 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00471Q8N535 108 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 OTOSQ8NHW6 89 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV17A0A0B4J275 112 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 CRPP02741 224 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 GNGT1P63211 74 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N2B8 174 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00301Q8NCQ3 95 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 HYLS1Q96M11 299 aa2.71□□□□□ -1.98
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RABGGTB-204ENST00000461653 KLK12Q9UKR0 248 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.985e-12■■■■■ 56.2
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RABGGTB-204ENST00000461653 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 hDV103S1A0JD37 113 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL26P61254 145 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
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RABGGTB-204ENST00000461653 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf62Q8N4C0 152 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N9L7 120 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 COX14Q96I36 57 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-204ENST00000461653 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.7□□□□□ -1.98
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