RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 AKAP14Q86UN6 197 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MED9Q9NWA0 146 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 XKRY2A2RUG3 117 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 F2Z2F3 143 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX46H3BTG2 121 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE6DO43924 150 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRGC1P0CF51 173 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GUV1 79 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2L6O14933 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 NTF3P20783 257 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 AMTP48728 403 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM12Q96EX1 92 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 NIT2Q9NQR4 276 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SLPIP03973 132 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL2P10415 239 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CTRLP40313 264 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1A2P50226 295 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 COTL1Q14019 142 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TWIST1Q15672 202 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC51BQ86UW2 128 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH3Q96FX2 82 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT11Q96G61 164 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 BIN3Q9NQY0 253 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CHTF8P0CG12 524 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GATD1Q8NB37 220 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TNXBP22105 4242 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR73Q6P4I2 378 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WYN8 130 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 K7EN84 100 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 C15orf56Q8N910 161 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 OCC1Q8TAD7 63 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CNFNQ9BYD5 112 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP161Q6P656 301 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GTSF1Q8WW33 167 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF185Q96GF1 192 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1HL1P0DM35 61 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 COX6A2Q02221 97 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 APCSP02743 223 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF6P10767 208 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZRU5 148 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 NCR2O95944 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 MAJINQ3KP22 176 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LRP2P98164 4655 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GVG6 124 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 H7C423 109 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PHOX2AO14813 284 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PMCHP20382 165 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 XCL1P47992 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 CEBPGP53567 150 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX261Q6UWH6 196 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 C7orf33Q8WU49 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM231BA6NCW3 169 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MWL6 223 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM250H0YL14 139 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 I3L3M4 83 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GAS8-AS1O95177 125 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 BLOC1S1P78537 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXI1Q12951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.5 ms