RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391002.1

SNORD12-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12-201ENST00000391002 PLXNA2O75051 1894 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 IGLC1P0CG04 106 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 NAIPQ13075 1403 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 C12orf73Q69YU5 71 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 AMELXQ99217 191 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 PRR15LQ9BU68 103 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 NRXN2Q9P2S2 1712 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CUL7Q14999 1698 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 PEG3Q9GZU2 1588 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SPEF2Q9C093 1822 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM262E9PQX1 116 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SSSCA1O60232 199 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SEC11AP67812 179 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 BAGE3Q86Y29 109 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 MGST2Q99735 147 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SMR3AQ99954 134 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 LENEPQ9Y5L5 61 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 R4GMQ9 66 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 NALCNQ8IZF0 1738 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.15□□□□□ -2.38
SNORD12-201ENST00000391002 AKAP11Q9UKA4 1901 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 LAMB1P07942 1786 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ZFHX3Q15911 3703 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 FAM223BA6NKX1 122 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 SFT2D2O95562 160 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 APOC3P02656 99 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 SMIM6P0DI80 62 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 UBE2D3P61077 147 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 UBE2D2P62837 147 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 DCDP81605 110 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 Q6JHZ5 121 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 BAGE2Q86Y30 109 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 CRIPTQ9P021 101 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 LAMC1P11047 1609 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 MYH6P13533 1939 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 MYH13Q9UKX3 1938 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 CNTLNQ9NXG0 1405 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 DOCK1Q14185 1865 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TANC1Q9C0D5 1861 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 IFT172Q9UG01 1749 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 A0A087WVE0 104 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 M0R143 59 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 UQCR11O14957 56 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 FXYD6P3P58550 94 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 CNFNQ9BYD5 112 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ABCC10Q5T3U5 1492 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 ARHGEF5Q12774 1597 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 HMGXB3Q12766 1538 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 SHROOM2Q13796 1616 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 APCP25054 2843 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 FAUP35544 74 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 COX6A2Q02221 97 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD12-201ENST00000391002 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms