RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NCR3O14931 201 aa15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB1O75438 58 aa15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 JMJD1CQ15652 2540 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G5P39877 138 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 RBM3P98179 157 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2AP49459 152 aa15.25■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 P0DMU3 169 aa15.24■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 FAM231AP0DMU4 169 aa15.24■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 FAM231CP0DMU5 169 aa15.24■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 MIAQ16674 131 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 LYRM9A8MSI8 78 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC2BQ92478 149 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 FOXI1Q12951 378 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM258P61165 79 aa15.21■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf173Q96LM9 149 aa15.21■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZSV7 163 aa15.21■□□□□ 0.03
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa15.21■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 ATOX1O00244 68 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 ALPK3Q96L96 1907 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 NFE4Q86UQ8 179 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YXY3 114 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 B5MCH6 92 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 PDE6GP18545 87 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 REG3AQ06141 175 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 IL17DQ8TAD2 202 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GX51 115 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 MP68P56378 58 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB8P28062 276 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 CRIP1P50238 77 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.16■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 H7C423 109 aa15.16■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 COX7BP24311 80 aa15.16■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N6K4 173 aa15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf177Q52M58 125 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 M0QY20 66 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf142B7Z368 130 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 INAFM1C9JVW0 142 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.13■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PTH2Q96A98 100 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf48Q5BLP8 95 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF843Q8N446 348 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 MIFP14174 115 aa15.1■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.1■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 TCL1BO95988 128 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV2-11P01706 119 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 RNF185Q96GF1 192 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-203ENST00000366687 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 U3KQK5 164 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM20Q8N5G0 67 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM223A0PJW6 202 aa15.08■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 HILS1P60008 231 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF702PQ9H963 129 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00643Q86TS7 51 aa15.07■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms