RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 IL17DQ8TAD2 202 aa15.03■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 XCL2Q9UBD3 114 aa15.03■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.03■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM223A0PJW6 202 aa15.02■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 RS1O15537 224 aa15.02■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G2AP14555 144 aa15.02■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.02■□□□□ -0
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-53P01767 116 aa15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AZU1P20160 251 aa15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 STHQ8IWL8 128 aa15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF479Q96JC4 524 aa15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.01□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 J3QQQ9 107 aa15.01□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 NF1P21359 2839 aa15□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RRN3P1Q2M238 152 aa15□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 VCX2Q9H322 139 aa15□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0J9YXV3 536 aa15□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2D1P51668 147 aa14.99□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 LEPROTO15243 131 aa14.98□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYBA4P53673 196 aa14.98□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.98□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 J3QKU1 62 aa14.97□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SAP30O75446 220 aa14.97□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.97□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 A6NJY4 79 aa14.96□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.96□□□□□ -0.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ACANP16112 2415 aa14.95□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-30P01768 117 aa14.95□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.95□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.95□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.94□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.94□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM238C9JI98 176 aa14.94□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF151Q2KHN1 245 aa14.94□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.93□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 K7ERU9 68 aa14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.92□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV1-51P01701 117 aa14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 HILS1P60008 231 aa14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZUT4 128 aa14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.9□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.9□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.9□□□□□ -0.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ITPR2Q14571 2701 aa14.89□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZTI0 123 aa14.89□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPAN13O95857 204 aa14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFA7O95182 113 aa14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BMG7 143 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 MTORP42345 2549 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 APOMO95445 188 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CFC1BP0CG36 223 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CFC1P0CG37 223 aa14.87□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.86□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.86□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 G3V4G9 280 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 K7EQD1 137 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 PRO0461Q9UI25 63 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 VPS25Q9BRG1 176 aa14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0J9YXY3 114 aa14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 F8W1H4 67 aa14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2D3P61077 147 aa14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2D2P62837 147 aa14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.83□□□□□ -0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 WFDC2Q14508 124 aa14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 LITAFQ99732 161 aa14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SMR3AQ99954 134 aa14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.82□□□□□ -0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms