RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.88□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 TMUB2Q71RG4 321 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 MLST8Q9BVC4 326 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 A0A096LNI7 61 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 TRGC1P0CF51 173 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 PMCHP20382 165 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 TSKUQ8WUA8 353 aa4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 APCSP02743 223 aa4.86□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.86□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.86□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.86□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 ARPC5O15511 151 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 GAGE2EQ4V326 116 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 Q86TA4 180 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 CCL25O15444 150 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 STAG3L2P0CL84 134 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 STAG3L3P0CL85 134 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 A0A1W2PRE2 83 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 APOMO95445 188 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 RASL11AQ6T310 242 aa4.85□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 FGF6P10767 208 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 ATP6V0CP27449 155 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 H2BFSP57053 126 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 S100A12P80511 92 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 UQCC3Q6UW78 93 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 PTH2Q96A98 100 aa4.84□□□□□ -1.63
LRP12-201ENST00000276654 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 APOC3P02656 99 aa4.84□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FMC1Q96HJ9 113 aa4.84□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 BCL2P10415 239 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 TWIST1Q15672 202 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 IQCJQ1A5X6 159 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 BORCS7Q96B45 105 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 TEX46H3BTG2 121 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 IFNA1P01562 189 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FCER1GP30273 86 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 OR5AL1P0C617 328 aa4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SERF2P84101 59 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 ZNF345Q14585 488 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 NIT2Q9NQR4 276 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FOXI1Q12951 378 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 RAB19A4D1S5 217 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 CAMPP49913 170 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 C5orf38Q86SI9 138 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 PRR34Q9NV39 138 aa4.82□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FAM74A7A6NL05 159 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 H0YIZ8 118 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 PAGE4O60829 102 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SVBPQ8N300 66 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 IMMP2LQ96T52 175 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 MRAP2Q96G30 205 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 COX7A2LO14548 114 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 BCL2L11O43521 198 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 BIN3Q9NQY0 253 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SLPIP03973 132 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 TMEM218A2RU14 115 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP12-201ENST00000276654 KRTAP10-8P60410 259 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1163.7 ms