RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639848.1

HLA-B-256, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

BASIC

Gene HLA-B, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-256	ENST00000639848	NIT1	Q86X76	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848		M0QY20	66 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	MGP	P08493	103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848		Q9HAA7	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848		A8MWL6	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	PSCA	O43653	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848		Q8N3U1	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HLA-B-256	ENST00000639848		A0A087WX48	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	TWIST1	Q15672	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	CDK2AP2	O75956	126 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	PKIA	P61925	76 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	ELOB	Q15370	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	FRZB	Q92765	325 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	PEA15	Q15121	130 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	RMI2	Q96E14	147 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM262	E9PQX1	116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HLA-B-256	ENST00000639848		C9JQL5	133 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848		Q0VG73	95 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848		A0A1B0GUT8	65 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848		V9GYV3	84 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	RYR1	P21817	5038 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848		Q8N814	137 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	ADIRF	Q15847	76 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HLA-B-256	ENST00000639848	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	CRP	P02741	224 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	RBX1	P62877	108 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	HSPG2	P98160	4391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	RAB14	P61106	215 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	GAGE6	Q13070	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	COTL1	Q14019	142 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848		Q8N976	141 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	GCSH	P23434	173 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	MIA	Q16674	131 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848		A0A1B0GUV1	79 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	RIG	Q13278	110 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HLA-B-256	ENST00000639848	WFDC2	Q14508	124 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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