RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ARID1B-222	ENST00000637003	CLLU1	Q5K131	121 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ARID1B-222	ENST00000637003	WDR73	Q6P4I2	378 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ARID1B-222	ENST00000637003	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ARID1B-222	ENST00000637003		V9GYV3	84 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1B0GVY2	172 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	CT83	Q5H943	113 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		M0QY20	66 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A087WWC5	75 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1B0GUT8	65 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		H7C1H1	209 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003		Q9HAA7	133 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	HERC2	O95714	4834 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	NIT1	Q86X76	327 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM262	E9PQX1	116 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	NIT2	Q9NQR4	276 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	RYR1	P21817	5038 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	RIG	Q13278	110 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003		K7EP13	123 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A087WX48	190 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	CAMP	P49913	170 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	GAGE6	Q13070	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	KLK12	Q9UKR0	248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	RAB4A	P20338	218 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	NCR2	O95944	276 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003		Q8N976	141 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-222	ENST00000637003	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003		F8W036	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	PSCA	O43653	123 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	ATRAID	Q6UW56	229 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	UBE2W	Q96B02	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A087WTM6	91 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	COTL1	Q14019	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	LAGE3	Q14657	143 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	FRZB	Q92765	325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	AMT	P48728	403 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	RBX1	P62877	108 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-222	ENST00000637003	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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