RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 GAS8-AS1O95177 125 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV2-11P01706 119 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 PTPRSQ13332 1948 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 ELANEP08246 267 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.78□□□□□ -0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 Q8N976 141 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRT-210ENST00000617474 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.78□□□□□ -0.52
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PTPRT-210ENST00000617474 SIRPDQ9H106 197 aa11.75□□□□□ -0.53
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PTPRT-210ENST00000617474 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRT-210ENST00000617474 TIMM17AQ99595 171 aa11.74□□□□□ -0.53
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PTPRT-210ENST00000617474 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRT-210ENST00000617474 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRT-210ENST00000617474 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.69□□□□□ -0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 LMO4P61968 165 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.67□□□□□ -0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 INSL3P51460 131 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRT-210ENST00000617474 GPHB5Q86YW7 130 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM126AQ9H061 195 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 J3QLI3 93 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
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